位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:《中国生物化学与分子生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q71[生物学—分子生物学] R73[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,长沙410008, [2]中南大学肿瘤研究所,长沙410008, [3]湖南师范大学医学院生物化学与分子生物学教研室,长沙410013, [4]南华大学药学与生命科学学院生物科学系,衡阳421001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30772401)~~
中文摘要:

NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.

英文摘要:

NPCEDRG is an NPC associated gene discovered by positional cloning from the patients in Hunan province in southern China,which is localized at a region frequently linked to NPC susceptibility at 3p21.3.Here we have identified at least seven possible alternative splicing(AS) variants of NPCEDRG transcripts in CNE2 cells,encoding 3 protein isoforms consist of 213,171 and 98 amino acids(aa).Seven possible TSSs were determined by 5′-RACE.As previously reported,the TSSs of variants NM_032316 and AK094248 were located-85 and-25 nt upstream of the translation start site;and the TSS of variant AF538150 was located-25 nt and mapped 17 nucleotides downstream of the start of the NPCEDRG sequence.We found that AF538150 contained a 6-nucleotide sequence(5′-TTGCAG-3′) and was of 516 nucleotides encoding a 171 aa peptide.We also discovered a new TSS variant from-23 nt and encoding 98 aa by its 297 nucleotides.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731