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基于棉花逆转座子的SSAP标记的开发
  • 期刊名称:江苏农业学报
  • 时间:0
  • 页码:1229-1233
  • 语言:中文
  • 分类:S562.01[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]江苏省农业科学院农业生物技术研究所,江苏南京210014
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(30871557);江苏省自然科学基金项目(BK2008346)
  • 相关项目:棉属野生种G.klotzschianum重要农艺性状单QTL置换系的创建
中文摘要:

从棉花BAC序列中鉴定了1个Ty1—copia类逆转座子,根据RNAseH—LTR连接区序列信息设计了特异引物,通过优化试验条件建立了一套经济、高效的SSAP(Sequence—specificamplificationpolymorphism)标记体系。分析棉属不同种的SSAP发现,SSAP在棉属不同种中均有丰富的扩增位点,而且棉花中SSAP多态性位点远高于AFLP(Fragmentlengthpolymorphicmarkers)。这一标记系统可增加棉花染色体端粒区域的标记密度,促进棉花高密度遗传图谱的构建。

英文摘要:

A Tyl-copia retrotansposon was identified from a cotton BAC sequence. Specific primers were designed based on RNase-LTR junction sequence. SSAP (Sequence-specific amplification polymorphism) analysis system was developed and applied in seven Gossypium species. All primer combinations amplified visible products in seven tested species. The results revealed that SSAP had higher level of polymorphism than amplified fragment length polymorphic markers (AFLP) in cotton. The study suggests that the SSAP marker system has potential for facilitating in constructing saturated genetic mapping in cotton.

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