位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
黄鳝主要组织相容性复合体Iα基因的克隆及多态性分析
  • ISSN号:1007-1032
  • 期刊名称:《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q959.482[生物学—动物学] S966.4[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]长江大学生命科学学院,湖北荆州434025
  • 相关基金:湖北省教育厅基金项目(Q20131206);长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放课题(2013A011)
中文摘要:

通过同源克隆,结合RACE技术,从黄鳝肝脏cDNA中分离得到了MHC 1α因的全长cDNA序列。结果表明:黄鳝MHC 1α因cDNA全长1731bp,5'UTR长78bp,3'UTR长600bp,编码1条350个氨基酸的多肽;与其他鱼类不同,黄鳝血基因只具有4个外显子和3个内含子。二级结构分析结果表明,该基因具有MHC尼基因的典型特征和保守区域。实时荧光定量PCR检测结果表明:黄鳝MHC 1α因在不同组织中表达量的差别较大;嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophilia)感染可显著影响黄鳝肝脏、肾脏和脾脏MHC 1α因的表达。对42个个体MHC 1α因外显子3序列的测定结果表明,42个个体共分离到50个等位基因,每个个体包含1~6个等位基因,推测黄鳝具有至少3个血基因座位;等位基因PBR位点和非PBR位点的氐值均显著大于ds(P〈0.05),提示黄鳝胁基因曾经历过强烈的正选择作用。

英文摘要:

The cloning process of full-length cDNA of MHC class 1α gene from swamp eel (Monopterus albus) was reported in the paper. The full length of cDNA, encoded with 350 amino acids, was 1 731 bp, including a 5 untranslated region (UTR) with 78 bp-long, and 3' UTR with a 600 bp-long. The genomic sequence was identified to be different from that of in other teleosts, which contained of four exons and three introns, Real-time quantitative PCR demonstrated that the MHC class Ia gene ubiquitously expressed in ten healthy tissues. Great changes in liver, spleen and kidney were observed after they infected by Aeromonas hydrophilia, a pathogenic bacteria. Fifty distinct alleles were isolated from forty-two individuals, and each of them had one to six alleles. The presence of six alleles in one individual suggested that there were at least three MHC la loci in the genome. Both at the protein-binding region (PBR) and at the non-PBR region, dN were significantly greater than ds (P〈0.05), which implied that the gene undergone a strong positive selection in swamp eel sequences.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南农业大学
  • 主办单位:湖南农业大学
  • 主编:官春云
  • 地址:长沙市芙蓉区农大路1号
  • 邮编:410128
  • 邮箱:zkb4618035@hunan.edu.cn
  • 电话:0731-84618035
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-1032
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1257/S
  • 邮发代号:42-157
  • 获奖情况:
  • 2006、2008、2010年连续三届全国高校精品科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17328