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利用酵母双杂交系统筛选与BnSmD1相互作用的蛋白
  • ISSN号:0490-6756
  • 期刊名称:《四川大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q37[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30871540)
中文摘要:

本研究以油菜BnSmD1为诱饵蛋白,利用酵母双杂交技术,从甘蓝型油莱cDNA文库中筛选出与之有相互作用的Arf-GTP酶激活蛋白1(Brassica napus ADP—ribosylation factor GTPase activating proteinl,BnArf GAP1),采用RT-PCR扩增并克隆到3个油菜ArfGAP基因的开放阅读框全长序列,BnArfGAP1、BnArfGAP2和BnArf GAP3.BnArfGAP1和BnArfGAP2都拥有1个507bp的开放阅读框,编码168个氨基酸残基;与前两个基因相比,BnAr,GAP3核苷酸序列中插入了一个93bp的带有终止密码子的外源片段,导致翻译的提前终止,它拥有1个249bp的开放阅读框,编码82个氨基酸残基.BnArfGAP1和BnArfGAP2核苷酸序列一致性达到98.22%;BnArfGAP1与BnArfGAP3核苷酸序列一致性达到82.83%,BnArfGAP2与BnArfGAP3核苷酸序列一致性达到84.17%.BnArfGAP1、BnArfGAP2和BnArfGAP3都含有一个C2结构域.

英文摘要:

From the Brassica napus eDNA library, BnArf GAP1 (Brassica napus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein1), wihch interacted with the bait protein, BnSmD1, was obtained by yeast two-hybrid system screening. By reverse transcription PCR, the open reading frames of three Arf GAP genes in Brassica napus were cloned, which were named as BnArf GAP1, BnArf GAP2 and BnArf GAP3, respectively. Both BnArf GAP1 and BnArf GAP2 possessed an open reading flame of 507 bp, encoding a protein of 168 amino acid residues. BnArfGAP3 possessed an open reading frame of 249 bp, encoding a protein of 82 amino acid residues, because its nucleotide sequence was inserted by an unhomologous 93bp sequence with a stop codon, which caused the early termination of translation. The nucleotide sequences of BnArf GAP1 and BnArf GAP2 had 98.22% similarity. The nucleotide sequences of BnArfGAP3 and the other two genes had 82.83% and 84. 17% similarity, respectively. All of the three proteins contained a C2 domain.

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期刊信息
  • 《四川大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:四川大学
  • 主编:刘应明
  • 地址:成都九眼桥望江路29号
  • 邮编:610064
  • 邮箱:
  • 电话:028-85410393 85412393
  • 国际标准刊号:ISSN:0490-6756
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1595/N
  • 邮发代号:62-127
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,四川省十佳科技期刊,教育部全国高校优秀学报二等奖(1995,1999),四川省科技优秀期刊一等奖(1996,2000)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10542