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Genic-SSR对中国兰的遗传背景分析
  • ISSN号:1672-1810
  • 期刊名称:《植物遗传资源学报》
  • 时间:0
  • 分类:S513[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]湖北大学生命科学学院,武汉430062, [2]浙江省农业科学院园艺研究所,杭州310021, [3]浙江省农业科学院花卉研究开发中心,杭州311202
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31201648); 钱江人才计划(2013R10081); 中国博士后科学基金(2012M521203);中国博士后科学基金特别资助(2013T60607); 浙江省博士后科研项目择优资助(Bsh1201032); 留学人员科技活动项目择优资助
中文摘要:

本研究利用本实验室开发的62个genic-SSR标记分析5个中国兰种的43个品种,其中52个标记呈多态性,其多态性指数(PIC)从0.054到0.824不等,平均为0.415,遗传多样性分析显示这43个材料之间的遗传距离平均为0.358,范围为0.016-0.600。对这些材料进行聚类分析和主成分分析,结果表明大多数来自一个物种的中国兰品种聚类在一起,而春兰分别聚类于几个系统树分支上,具有多起源性。与地理分布信息交叉分析发现:同一物种的品种往往聚类于一个大的系统树分支,但来自于不同地区的品种分别聚类于不同小分支;一些来自临近地域的品种往往聚类在一起,而这些品种有时不属于同一物种。这些结果说明遗传背景和地理环境存在一定的联系。

英文摘要:

A total of 62 genic-SSR makers were used for genetic analysis of 5 Chinese Cymbidium species including 43 accessions. The results showed that 52 were polymorphic,and their polymorphic index content( PIC) averaged 0. 415,ranging from 0. 054 to 0. 824. The pairwise genetic distance among 43 accessions averaged 0. 389,ranging from 0. 016 to 0. 600. The phylogenetic analysis and principle component analysis( PCA) showed that the most of accessions derived from the same species were grouped together. However,C. goeringii accessions did not always form a separate cluster,suggesting that C. goeringii accessions were polyphyletic. Interdisciplinary cross-analysis of genetic and geographic background indicated that some accessions from same species were clustered into different branches based on their origins. While some other accessions from near regions also clustered together. These results indicated that there appeared to be a connection between genetic and geographic background of these Chinese cymbidium accessions.

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期刊信息
  • 《植物遗传资源学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院作物科学研究所 中国农学会
  • 主编:刘旭
  • 地址:北京中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwyczyxb2003@163.com/sina.com/caas.cn
  • 电话:010-82105794 82105795
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-1810
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4996/S
  • 邮发代号:82-643
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:10278