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霍乱弧菌主要毒力和管家基因序列分析
  • ISSN号:1001-0580
  • 期刊名称:《中国公共卫生》
  • 时间:0
  • 分类:R378[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]南方医科大学南方医院检验科,广州510515, [2]广东省疾病预防控制中心, [3]中国疾病预防控制中心传染病预防控制所, [4]南方医科大学流行病学教研室,广州510515
  • 相关基金:国家自然科学基金(30170821);广东省自然科学基金(990393)
中文摘要:

目的分析广东霍乱弧菌(VC)代表菌株主要毒力基因和管家基因序列。方法PCR扩增霍乱弧菌的主要毒力基因(ctxAB和tcpA)和管家基因(dnaE、hlyA、mdh和recA)、基因测序、对序列进行生物信息学分析。结果不同年代分离的2株埃尔托型(EVC)产毒株和1株0139群VC产毒株的主要毒力基因序列与国内外相关报告比较,ctxA基因及推测的氨基酸序列的同源性分别为99.7%~100%和98.8%~100%.ctxB基因及推测的氨基酸序列的同源性分别为98.8%~100%和96.8%~100%,tcpA基因序列与EVC国际标准株N16961 100%同源。3株产毒株的dnaE、hlyA、mdh和recA基因序列同源性分别为99.8%~100%,100%,99.5%~99.8%和100%,氨基酸序列同源性分别为100%.100%,98.5%~99.3%和100%;3株产毒株和O139群VC非产毒株的管家基因序列同源性分别为97.0%~97.2%,91.8%,94.1%~94.4%,96.9%,氨基酸序列同源性分别为100%,94.6%,94.3%~98.5%和99.7%。结论广东省不同年代EVC产毒株和O139群VC产毒株的群体遗传学关系高度密切,而与O139群VC非产毒株较远,O139群VC产毒株可能起源于EVC产毒株。

英文摘要:

Objective To analyse the sequences of important toxic genes and housekeeping genes of Vibrio cholerae strains isolated from Guangdong province. Methods Toxic genes(ctxAB and tcpA), and housekeeping genes(dnaE, hlyA, mdh and recA)of Vibrio cholerae were obtained by PCR, sequenced and analysed. Results Toxic genes of 2 toxic EVC strains and 1 toxic O139 VC strain were analysed with those reported by others. The identities of ctxA and CtxA were 99.7 % - 100 % and 98.8 % - 100 % . The identities of ctxB and CtxB were 98.8 % - 100 % and 96.8 % - 100 %. The identity of tcpA of 3 toxic strains was 100%, and sequences of tcpA were the same as that of international standard EVC (N16961). The identities of dnaE, hlyA, mdh, and recA of 3 toxic VC strains were 99.8% - 100%, 100%, 99.5% - 99.8%,and 100%. The identities of DnaE, HIyA, Mdh, and RecA of 3 toxic VC strains were 100%, 100%, 98.5% - 99.3 %, and 100 % . The identities of dnaE, hlyA, mdh, and recA of 3 toxic VC strains and 1 non-toxic O139 VC strain were 97.0 % - 97.2 %, 91.8 %, 94.1% - 94.4 %, and 96.9 %. The identities of DnaE, HlyA, Mdh, and RecA of 3 toxic VC strains and 1 non-toxic O139 VC strain were 100 %, 94.6 %, 94.3 % - 98.5 %, and 99.7 %. Conclusion Toxic EVC strains and toxic O139 VC strain isolated from Guangdong province are very closely related and there has been a high of recombination in their evolution.

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期刊信息
  • 《中国公共卫生》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会
  • 主编:王宇
  • 地址:沈阳市和平区砂阳路242号
  • 邮编:110005
  • 邮箱:zgggws@vip.sina.com
  • 电话:024-23388443 23388479
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-0580
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1234/R
  • 邮发代号:8-204
  • 获奖情况:
  • 1999年获中华预防医学会系列期刊优秀期刊二等奖,2000年获中华预防医学会系列期刊优秀期刊三等奖,国家期刊提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:66800