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应用多位点VNTR分析进行铜绿假单胞菌院内感染溯源的研究
  • ISSN号:1672-9455
  • 期刊名称:检验医学与临床
  • 时间:2015.10
  • 页码:2811-2813
  • 分类:R378.99[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]海军总医院检验科,北京100048
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31170008)
  • 相关项目:基于可变串联重复序列的溶藻弧菌基因分型及基因组多态性研究
中文摘要:

目的:应用多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析方法进行多重耐药铜绿假单胞菌分子分型,为由铜绿假单胞菌引发的院内感染的溯源和流行病学调研提供依据。方法从铜绿假单胞菌基因组中筛选12个VNTR位点,设计合成引物;对98株多重耐药铜绿假单胞菌进行PCR扩增,产物毛细管电泳;根据产物大小计算各VNTR位点的重复数,构建系统发育树,进行数据分析。结果12个位点的多态性指数(DI)为0.45~0.88,将98株铜绿假单胞菌分成5个群,88个基因型,同病区分离的菌株具有一定的同源性。结论多位点VNTR分析具有很高的分辨率,适用于铜绿假单胞菌基因分型和溯源研究,具有很好的应用前景。

英文摘要:

Objective To conduct the molecular typing of multi‐drug‐resistance Pseudomonas aeruginosa by u‐sing the multi‐loci VNTR analysis to provide the basis for the traceability the nosocomial infection caused by Pseudo‐monas aeruginosa and epidemiological survey and research .Methods 12 VNTR loci were screened from the Pseudo‐monas aeruginosa genome and the PCR primers were designed .98 strains of multi‐drug‐resistance Pseudomonas aeruginosa were perfromed the PCR amplification by using the above primers and the products were conducted the capillary electrophoresis .The repeat numbers of various loci were calculated according to the products size and the phylogenetic tree was constructed for conducting the data analysis .Results The diversity index(DI) of 12 loci ranged from 0 .45 - 0 .88 ,and 98 strains of Pseudomonas aeruginosa were grouped into 5 clusters ,88 genotypes .The isolates from the same ward presented certain homology .Conclusion The multi‐loci VNTR analysis presents higher discrimi‐nation power and suitable for genotyping and traceability research of Pseudomonas aeruginosa ,and has good applica‐tion prospect .

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期刊信息
  • 《检验医学与临床》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:重庆市卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:重庆市卫生信息中心 重庆市临床检验中心
  • 主编:吴开明
  • 地址:重庆市渝北区宝环路420号
  • 邮编:400014
  • 邮箱:cqwsxx@163.com
  • 电话:023-63613484
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9455
  • 国内统一刊号:ISSN:50-1167/R
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国医学期刊协作网优秀期刊,重庆市一级期刊,中国科技论文在线优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:42029