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鸭坦布苏病毒TaqMan荧光定量PCR方法的优化
  • ISSN号:1008-0589
  • 期刊名称:中国预防兽医学报
  • 时间:2013.4.15
  • 页码:294-298
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]济南大学化学化工学院,山东济南250022, [2]中国农业科学院上海兽医研究所禽病实验室,上海200241
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项经费项目(201003012);国家自然科学基金(31172332)
  • 相关项目:新发鸭坦布苏病毒分子致病机制研究
中文摘要:

为提高鸭坦布苏病毒(DTMUV)TaqMan荧光定量PCR方法的敏感性和简化反应条件,本研究在前期建立的TaqMan荧光定量PCR方法的基础上,设计一条特异性的反转录引物,优化反应体系,建立了简便、快速、敏感的TaqMan荧光定量PCR方法。该荧光定量PCR方法最低检测限为10拷贝,敏感性是未优化的荧光定量PCR方法的5倍、是普通PCR方法的100倍,并且该方法对DTMUV的最低检测限是0.01半数鸡胚致死量(ELD。)。通过批内和批间实验的变异系数表明优化的荧光定量PCR方法的重复性比未优化的荧光定量PCR方法好。通过该优化的荧光定量PCR方法检测其它常见的鸭病病毒的DNAs或RNAs,证明了该方法特异性好。对现地60份疑似DTMUV的样品进行检测,用该方法检出57份样品为阳性,明显高于普通PCR,并且在区分35Ct值左右样品试验中敏感性优于未优化的荧光定量PCR方法。该优化的DTMUVTaqMan荧光定量PCR方法更适用于DTMUV的快速定量流行病学诊断。

英文摘要:

To establish a sensitivity method for the detection of the newly emerged duck Tembusu virus (DTMUV), an optimized TaqMan real-time PCR assay was developed and by using a specific reverse transcription primer and an optimized reaction buffer based previous TaqMan real-time PCR assay. The detection limit of the optimized real-time PCR assay was 10 copies, the sensitivity of this assay was 5 times than non-optimized real-time PCR assay, and sensitive was 100 times than the conventional PCR. For the DTMUV, the detection limit of the optimized assay was 0.01 ELDso. The reproducibility of this optimized real-time PCR assay was verified better than non-optimized assay using inter- and intra- assay. The specificity of the real-time PCR assay were confirmed using RNAs and DNAs extracted fTom other duck viruses. The reliability of this real-time PCR assay was confirmed in 57 of the 60 tissue samples collected from clinical suspected DTMUV infected ducks, the positive coincidence rate was 100% with the conventional PCR and non-optimized real-time PCR. The results reveal that the optimized real-time PCR assay might be a useful diagnostic method for epidemiologically investigating the emerged DTMUV.

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期刊信息
  • 《中国预防兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
  • 主编:步志高
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路678号
  • 邮编:150001
  • 邮箱:zgyfsyxbhvri@163.com
  • 电话:0451-51051811 51051812
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0589
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1417/S
  • 邮发代号:14-70
  • 获奖情况:
  • 全国农业优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12844