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贵州黄牛mtDNA D-loop遗传多样性研究
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌712100, [2]贵州大学动物科技学院,贵阳550025, [3]贵州省农业厅,贵阳550001
  • 相关基金:贵州省十五攻关项目“贵州优质肉牛产业化技术研究及示范工程”(黔科合农社字(2001)1143号);国家自然科学基金(编号:30471238)
中文摘要:

对贵州4个地方黄牛品种共计82个个体的线粒体DNA D-loop区全序列910bp进行分析,检测到31种单倍型,其核苷酸多态位点65个,约占所测核苷酸总长的7.14%,其中有62个转换,2个颠换,1个转换/颠换共存。贵州4个黄牛品种mtDNA D-loop区核苷酸多样度(π值)为2.16%~2.61%,单倍型多样度(H)为0.695~0.909,表明贵州黄牛mtDNA遗传多样性比较丰富。根据单倍型构建了贵州4个黄牛品种的NJ分子系统树。聚类表明,贵州黄牛有普通牛和瘤牛2大母系起源,其影响较为均一。并探讨了用核苷酸多样度π值的大小来衡量黄牛群体遗传分化程度的可行性。

英文摘要:

The complete mitochondrial D-loop sequences, 910 bp in length, in 82 individual cattle from 4 breeds in Guizhou province were analyzed. The results revealed 31 mitochondrial haplotypes, 65 polymorphic sites, covering 7. 14% of the entire length of the sequence. Among these polymorphic sites, there were 62 transitions, 2 transversions and 1 coexistent site of transition and transversion. The nucleotide diversity (π value) and haplotype diversity (H) estimated from mtDNA D-loop region in 4 cattle breeds in Guizhou varied from 2.16% - 2.61% and 0. 695 - 0.909, respectively, showing that abundant mitochondrial genetic diversity exists in Guizhou cattle breeds. The Neighbor- Joining molecular phylogenetic tree of mtDNA D-loop of 4 Guizhou cattle breeds was constructed according to the 31 haplotypes. The NJ tree indicated that the origin of cattle breeds was from Bos taurus and Bos indicus which had nearly the same influence on cattle breeds in Guizhou. The feasibility of applying nucleotide diversity (π value) to the evaluation of bovine genetic differentiation was discussed.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
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  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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