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波纹裸胸鳝线粒体DNA D-loop多态性分析
  • ISSN号:1671-6647
  • 期刊名称:《海洋科学进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q959.469[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]海南大学海洋学院,海南海口570228, [2]海南大学热带生物资源教育部重点实验室,海南海口570228
  • 相关基金:国家科技支撑计划(40966003); 海南省热带水生生物技术重点实验室开放基金(shkyjj0801); 海南省自然科学基金(808122)
中文摘要:

对分布于我国海南东部海域的波纹裸胸鳝群体(n=21)的mtDNA D-loop区987 bp全序列进行了分析。结果表明:21条波纹裸胸鳝D-loop区序列中,A+T平均含量为62.5%;经比对,共检测到177个核苷酸多态位点,约占核苷酸总数的18.7%;D-loop全序列突变类型有5种,即转换158、颠换18、插入2、缺失1及转换与颠换共存1,它们分别占核苷酸多态位点的89.3%、10.1%、0.3%、0.15%及0.15%。由此构建了中国海南沿海21条波纹裸胸鳝的NJ分子系统树,聚类分析表明:所测波纹裸胸鳝的mtDNA D-loop序列表现为2个单倍型组,从而可以看出这21条波纹裸胸鳝可能有2个母系起源,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。

英文摘要:

In this study,987 bp sequences of mtDNA D-loop region,from 21 UndμLatus Gymnothorax in Hainan coast in China,were analyzed.The results showed that: among all the D-loop sequences in the 21 U.Gymnothorax,the content of A+T reached 62.5% on average;there were 177 nucleotide polymorphisms detected by comparison,accounting for 18.7% in the total number of nucleotide;there were 5 types of mutations in D-loop sequences that 158 transitions,18 transversions,2 inserts,1 missing and 1 coexistence of transition and transversion,which accounted for nucleotide polymorphisms 89.3%,10.1%,0.3%,0.15% and 0.15%,respectively.Thus the NJ phylogenetic trees of this 21 U.Gymnothorax in Hainan's coast were constructed.The cluster analysis showed that: all the measured sequences assumed to be two haplotypes.So it could be inferred that the 21 U.Gymnothorax may originated from two maternal ancestors and there were no obvious geographical differences between them seen from genealogical tree.

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期刊信息
  • 《海洋科学进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家海洋局科技司
  • 主办单位:中国海洋学会 国家海洋局第一海洋研究所
  • 主编:袁业立
  • 地址:青岛市高新技术区仙霞岭路6号
  • 邮编:266061
  • 邮箱:hbhh@chinajournal.net.cn
  • 电话:0532-88967804
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6647
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1387/P
  • 邮发代号:24-58
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,中文核心期刊,中国科技核心期刊,IAPSO中国委员会特约期刊,第三届华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4854