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蛇四棘食道口线虫线粒体cox1基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128
  • 相关基金:国家自然科学基金(30771616); 湖南省科技计划一般项目(K0902144-21); 长沙科技计划一般项目(2010FJ3006)
中文摘要:

本研究旨在分析长沙市四棘食道口线虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况。应用聚合酶链反应(PCR)扩增四棘食道口线虫虫株的pcox1,应用Clustal X 1.83程序对序列进行比对,同时利用DNAStar 5.0中的MegAlign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知四棘食道口线虫相应基因序列进行比较分析。所得pcox1序列长度一致,均为393 bp,与GenBank公布的线虫相关序列进行比较分析结果表明,各个分离株与已知四棘食道口线虫相应基因的相似性分别在98%以上,与其它科线虫的相似性均小于91%。四棘食道口线虫pcox1序列种内相对保守,种间差异明显。本研究为进一步研究四棘食道口线虫的群体遗传学奠定了基础。

英文摘要:

To analyze the differences in cytochrome c oxidase subunit 1(cox1) gene of Oesophagostomum quadrispinulatum isolated from Changsha city.The partial cox1(pcox1) was amplified from each O.quadrispinulatum sample,and pcox1 sequences were aligned using the Clustal X 1.83.Sequence homology analysis was performed using the MegAlign program of the software DNAStar version 5.0 by comparing with the corresponding sequence of O.quadrispinulatum available in GenBankTM.The results showed that the lengths of pcox1 were 393 bp.Sequence comparison revealed that the similarity in pcox1 sequences among Changsha isolates and that of the O.quadrispinulatum available in GenBankTMwere over 98%.There was no significant variation in pcox1 sequences within O.quadrispinulatum,while inter-species difference was obviously.The results provided a foundation for further studies of molecular identification and molecular genetics of O.quadrispinulatum.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619