位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:R521[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]首都医科大学附属北京儿童医院儿科研究所,北京100045, [2]北京胸科医院检验科,北京100095, [3]俄罗斯圣彼得堡巴斯德研究所,圣彼得堡197101
  • 相关基金:国家自然基金资助项目(30471841)
中文摘要:

目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics软件。结果24个位点的多态性差异较大,位点QUB-11b(HGI 0.651)、Mtub 21(HGI 0.556)和QUB-26(HGI 0.518)的多态性较高,有两个位点(MIRU2和MIRU24)则不具有多态性;不同VNTR位点组合(12位点,15位点,24位点)在北京基因型菌株中的分辨指数依次升高,分别为0.788,0.990.0.992,后两个组合的差异仅是由位点Mtub 29引起的。结论不同的VNTR位点在北京地区北京基因型菌株中的分辨力存在差异;推荐的基础VNTR15位点与Mtub 29组合可作为北京地区结核分枝杆菌分子流行病学研究的一线方法。

英文摘要:

The newly proposed variable-number tandem-repeat (VNTR) typing system, including basic 15-locus set and high-resolution 24-locus set, were evaluated in 72 Beijing genotype Mycobacterium tuberculosis isolated from Beijing area in China. As a result, 24 loci showed different discriminatory, in which QUB-11b (HGI 0. 651), Mtub 21 (HGI 0. 556) and QUB-26 (HGI 0. 518) were the relatively more polymorphic loci, MIRU 2 and MIRU 24 had extremely low resolution among Beijing genotype strains (HGI 0). The most widely used 12-locus set had limited power (HGI 0. 788) in this sample collection. A dramatically increased resolution was observed by using the proposed VNTR 15-locus and 24-locus set, with HGI of 0. 990 and 0. 992, respectively. The subtle difference in HGI was originated from one locus Mtub 29, which was included in 24-locus system. Thus, the proposed VNTR 15-locus plus Mtub 29 can be served as the first screening method in routine epidemiological study in Beijing area.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000