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DG01株H5N1亚型禽流感病毒全基因组序列分析
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:S858.2[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华南农业大学兽医学院,广州510642, [2]广东省实验动物监测所,广州510260
  • 相关基金:国家自然科学基金(30270987,30440010)和广东省自然科学基金(020996)联合资助项目
中文摘要:

根据国内外已公布的AIVH5N1亚型全基因组序列设计了8对引物,对H5N1亚型高致病力禽流感病毒毒株A/Duck/Guangdong/DG01/05(简称DG01)毒株进行了全基因组RT-PCR、测序及序列分析。DG01株基因组由PB22341bp,PB1 2341bp,PA2 233bp,HA1 779bp。NP1 565bp,NA1 398bp,M1 027bp。NS 875bp8个节段组成,与往年及同年一些流行株比较分析结果显示。DG01株具有高致病性禽流感病毒基因特征,NA基因及NS1基因均有部分缺失,从基因特点分析属于2005年流行代表株。

英文摘要:

With the genome of AIV H5N1 subtype in Genbank,we had designed 8 pairs of primers, cloning the 8 fragments from the A/Duck/Guangdong/DG01/05 (H5N1 subtype, abbre: DG01 strain), sequenced and analyzed. The sequences indicated that the genome of DG01 strain was composed of 8 fragments, which were PB2 2 341bp, PB1 2 341bp, PA 2 233bp, HA 1 779bp, NP 1 565bp, NA 1 398 bp, M 1 027bp, NS 875 bp, coding for 11 proteins. Compared with the most stainsin Mainland strains,The DG01 strain shared the amino acid sequence as RERRRKKR at the cleavage site between HA1 and HA2, which was the feature of the highly pathogenic avian influenza virus. DG01 had amino acids deletion in the NA stalk from the sites 49 to 68 and NS1 from 80 to 84, which were prominet characteristics of the H5N1 strains isolated from mainland China in recent years.

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000