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檀香心材总RNA提取方法的比较研究
  • ISSN号:1005-3395
  • 期刊名称:《热带亚热带植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S791.22[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中国科学院华南植物园,广州510650, [2]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31270720;31100498);广东省自然科学基金项目(S2012010009025);广东省科技项目(2015B020231008);中国科学院STS项目子课题(KFJ-EW-STS-118)资助
中文摘要:

为筛选檀香心材总RNA提取方法,对5种提取方法进行比较研究,包括Trizol法、改良CTAB法、SDS酸酚法、异硫氰酸胍-CTAB法、异硫氰酸胍-SDS法。结果表明,Trizol法和异硫氰酸胍-CTAB法不能提取出檀香心材总RNA,而SDS酸酚法、改良CTAB法和异硫氰酸胍-SDS法均能提取檀香心材总RNA。SDS酸酚法的A260nm/A230nm小于2.0,且RNA产率低,仅为(27.94±1.06)μgg–1,不能满足后续实验要求。而改良CTAB法和异硫氰酸胍-SDS法提取的总RNA带型清晰,完整性好,A260nm/A280nm为1.8~2.0,A260nm/A230nm大于2.0,RNA产率分别为(79.06±4.22)和(107.00±1.36)μgg–1。分别以改良CTAB法和异硫氰酸胍-SDS法提取的总RNA为模板,通过RT-PCR反应,扩增檀香Actin基因片段,结果二者扩增产物大小相同且条带单一,说明改良CTAB法与异硫氰酸胍-SDS法为檀香心材总RNA提取的较好方法。

英文摘要:

In order to screen RNA extracting method from heartwood of Santalum album, five methods were compared, including Trizol method, improved CTAB method, SDS-phenol method, guanidine isothiocyanate-CTAB method, and guanidine isothiocyanate-SDS method. The results showed that it was difficult to extract totalRNA by Trizol method and guanidine isothiocyanate-CTAB method, and the improved CTAB method,SDS-phenol method and guanidine isothiocyanate-SDS method could successfully extract total RNA. TheSDS-phenol method was not suitable for RNA extraction, because A260 nm/A230 nm was less than 2.0 and total RNAyield was low with (27.94±1.06) μg g–1. However, the 28S rRNA and 18S rRNA bands of total RNA extracted byimproved CTAB method and guanidine isothiocyanate-SDS method were clear, A260 nm/A280 nm ranged from 1.8 to2.0, A260 nm/A230 nm were more than 2.0, the yields were (79.06±4.22) and (107.00±1.36) μg g–1, respectively. The Actin segments in total RNA extracted by improved CTAB method and guanidine isothiocyanate-SDS method could amplificated with the same size and sigle band. Therefore, the improved CTAB methodand and guanidine isothiocyanate-SDS method were effective methods to extract total RNA from heartwood of S. album.

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期刊信息
  • 《热带亚热带植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院华南植物园 广东省植物学会
  • 主编:黄宏文
  • 地址:广州市天河区兴科路723号中国科学院华南植物园行政办公楼2楼
  • 邮编:510650
  • 邮箱:jtsb@scib.ac.cn
  • 电话:020-37252514
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-3395
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1374/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,广东省优秀科技期刊,执行《CD-CAJ》规范奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11360