位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
基于混沌游走表示的p53家族基因的进化差异性分析
  • ISSN号:1001-4160
  • 期刊名称:《计算机与应用化学》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] O29[理学—应用数学;理学—数学]
  • 作者机构:江南大学理学院,江苏无锡214122
  • 相关基金:国家自然基金资助(11271163)
中文摘要:

P53家族基因和肿瘤密切相关,为研究其进化差异性,首先利用混沌游走表示的方法,将p53家族基因的CDS序列映射为平面直角坐标系中的点列。继而,利用点列的坐标值构造加权特征向量,以此对CDS序列进行数值刻画。接着,基于欧式距离对CDS序列作聚类分析,并定义组内精度和分组优度来评价聚类分析的结果。最后,结合基因分段和方差分析等方法进行深入研究,从而获得更为理想的分类效果。结果表明,p53家族基因的进化差异性主要体现在CDS序列的前三分之二段和加权特征向量的第2维和第7维上,这对研究p53家族基因序列具有重要意义。

英文摘要:

P53 family genes are closely related to the tumor. To study the evolutionary diversity between them, the authors firstly applied chaos game representation to map p53 family genes' CDS sequences as point series in the rectangular plane coordinate system. Secondly, by translating the coordinates of point series, the weighted feature vector was used as numerical characterization of CDS sequences. What's more, we did cluster analysis on CDS sequences based on Euclidean distance, and defined accuracy in group and group optimization measurement to evaluate the results. In the end, gene dividing and analysis of variance were employed in the deep research, and a more ideal clustering effect was obtained. The results indicate that, the evolutionary diversity of p53 family mainly reflects in CDS sequences' first 2/3 segments and feature vextor 's second and seventh dimension. The conclusion is of vital importance to study the sequences of p53 family genes.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《计算机与应用化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院过程工程研究所
  • 主编:王基铭
  • 地址:北京中关村北二街1号
  • 邮编:100080
  • 邮箱:jshx@home.ipe.ac.cn
  • 电话:010-62558482
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-4160
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3763/TP
  • 邮发代号:82-500
  • 获奖情况:
  • 1991年中国科学院优秀期刊三等奖,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,1998年中国科技期刊影响因子工程类第二名,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:9060