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Boosting算法对卵巢癌代谢组数据的应用研究
  • ISSN号:1002-3674
  • 期刊名称:中国卫生统计
  • 时间:2012
  • 页码:786-789
  • 分类:R730.3[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]复旦大学公共卫生学院卫生统计教研室,200032, [2]复旦大学附属肿瘤医院临床资料统计室
  • 相关基金:国家青年科学基金项目资助(81001286); “中央高校基本科研业务费专项资金”资助
  • 相关项目:基于进化组合支持向量机(EC-SVM)的代谢组学数据分析方法研究
中文摘要:

目的应用Boosting算法建立模型,对卵巢癌和非卵巢癌(卵巢囊肿和子宫肌瘤)患者的尿液代谢组数据进行分析,提取出具有生物学意义的代谢组分,为卵巢癌的早期诊断及疾病机理提供线索。方法将决策树与Boosting算法相结合,对患者的临床样品代谢组数据进行分析,并对代谢组分进行逐步筛选,得到鉴别卵巢癌患者的重要代谢组分。结果由Boosting模型得到的排序靠前的10个差异代谢组分,能够将卵巢癌与对照组患者进行较好的判别分类,其ROC曲线下面积达到了0.944。结论 Boosting模型可以有效地应用于卵巢癌代谢组数据,在保证较高的分类正确率的同时可以得到对分类起作用的重要的代谢组分。

英文摘要:

Objective Boosting model was built to analyze the metabonomics data from ovarian cancer and ovarian cyst patients urine.Some biological metabolites were also extracted from the data,which would provide some clues to the early diagnosis.Methods Boosting and decision tress were combined to analyze the metabnomics data and the important metabolites were achieved according to their importance scores.Results The top ten metabolites were extracted and the area under ROC curve was 0.944,which provided a better classification results than the original dataset.Conclusion Boosting could be effectively applied to the classification of ovarian cancer metabnomics data,important features could also be extracted at the same time.

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期刊信息
  • 《中国卫生统计》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 主编:孟群
  • 地址:沈阳市沈北新区蒲河路77号
  • 邮编:110122
  • 邮箱:zgwstj@126.com
  • 电话:024-31939626
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-3674
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1153/R
  • 邮发代号:8-39
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20780