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油菜APETALA3基因5′调控序列的克隆及分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院,成都610064
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30571174,30871540)
中文摘要:

利用单引物PCR方法获得了甘蓝型油菜APETALA3重复基因拷贝BnAP3-3和BnAP3-4的5′调控序列。分析结果表明,两段调控区序列一致性为80.43%,大多数的保守功能元件如TATA盒和CAAT盒没有明显差异,都含有一些应对环境胁迫及诱导的元件,如MYB1AT、GATABOX和DOFCOREZM等。少数顺式作用元件存在较大差异,其中CGACGOSAMY3、CArG box、CARGCW8GAT及CAREOSREP1为BnAP3-3的5′调控序列所特有,而BnAP3-4的5′调控序列则含有GT1CONSENSUS。半定量RT-PCR显示,BnAP3-3表达量远高于BnAP3-4,可能与二者调控区某些功能元件序列差异有关。

英文摘要:

The 5′ regulatory region of two APETALA3 duplicated genes BnAP3-3 and BnAP3-4 in Brassica napus were cloned using single primer PCR.Sequence analysis showed that the two 5′ regulatory region sequences have 80.43% homologous with each other.Most of the conserved cis-regulatory elements were similar,such as TATA-box,CAAT-box and some stress responsive elements including MYB1AT,GATABOX and DOFCOREZM motifs.There were also a few different motifs between them.CGACGOSAMY3,CArG box,CARGCW8GAT and CAREOSREP1 motifs were found in the 5′ regulatory region of BnAP3-3,while the 5′ regulatory region of BnAP3-4 contained GT1CONSENSUS motif.The semi-quantitative RT-PCR demonstrated that the relative expression of BnAP3-3 was significantly higher than that of BnAP3-4.The results indicated that the cause of the expression difference of the two genes may be from the sequence difference of their 5′ regulatory region.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104