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Identification and evolutionary implication of four novel box H/ACA snoRNAs from Giardia lamblia
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education, StateKey Laboratory for Biocontrol, Zhongshan University, Guangzhou510275, China
  • 相关基金:gratefully acknowledge the technical assistance of Chen Xiaohong. This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 30230200 & 30370328), the funds from the Ministry of Education of China and Natural Science Foundation of Guangdong Province (Grant No. IRT0447, NSF-05200303), and the National Basic Research Program (Grant No. 2005CB724600).
中文摘要:

从一个专业化 cDNA 图书馆,四新奇盒子 H/ACA snoRNAs,命名 GLsR22, GLsR23, GLsR24 和 GLsR25,从原始优核质被识别, Giardia lamblia.Bioinformatics 分析显示所有能潜在地他们被合拢进两倍发卡,盒子 H/ACA snoRNAs 的典型第二等的结构。当时, GLsR24 和 GLsR25 被预言分别地,在 23S rRNA 上在 U1753 和 U2396 指导 thesite 特定的 pseudouridylation GLsR22 andGLsR23 属于家庭使 snoRNAs “变成孤儿”。所有被单个拷贝基因四新奇 snoRNAs 编码并且定位了在小内部遗传因子的区域。与以前在 Archaea 和另外的单细胞的原生动物门报导的对应物相比,有趣地,盒子 H/ACA snoRNAs 从 G 识别了。lamblia 有唯一的结构的特征,暗示那 snoRNAs 以不同方法从初核质演变到优核质。

英文摘要:

From a specialized cDNA library, four novel box H/ACA snoRNAs, named GLsR22, GLsR23, GLsR24 and GLsR25, were identified from the primitive eukaryote, Giardia lamblia. Bioinformatics analyses indicated that all of them can be potentially folded into double hairpins, the typical secondary structures of box H/ACA snoRNAs. GLsR24 and GLsR25 are predicted to guide the site-specific pseudouridylation at U1753 and U2396 on 23S rRNA respectively, while GLsR22 and GLsR23 belong to the family of "orphan" snoRNAs. All of the four novel snoRNAs are encoded by single copy genes and located in small intergenic regions. Interestingly, compared with the counterparts previously reported in Archaea and other unicellular protozoan, the box H/ACA snoRNAs identified from G. lamblia have unique structural features, implying that snoRNAs evolved from prokaryotes to eukaryotes in different ways.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851