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基于分子和表型性状的大豆骨干品种遗传多样性分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:华北农学报
  • 时间:2013.2.28
  • 页码:19-26
  • 分类:S565.03[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]河北省农林科学院粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,农业部黄淮海大豆生物学与遗传育种重点实验室,河北石家庄050031, [2]中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,北京100081, [3]黑龙江省农业科学院绥化农业科学研究所,黑龙江绥化152052
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划“863计划”(2006AA100104); 国家自然科学基金项目(31100880); 河北省自然科学重点基金(C2012301020); 河北省高层次人才创新工程(F12E03002); 优秀留学回国人员一类重点资助(C2011006001); 河北省应用基础研究重点基础研究项目(129655160)
  • 相关项目:大豆杂交种和亲本间的比较转录组研究
中文摘要:

绥农14是集优质、高产、抗病、广适应性于一身的大豆优良品种,对绥农14系谱亲本进行分子和表型的遗传基础解析,为有目的地选择杂交亲本拓宽遗传基础提供理论指导。利用包含有生长性状、产量性状、品质性状、抗逆性状、固氮性状在内的50个表型性状和550个微卫星位点对绥农14系谱亲本进行分析。550个SSR位点共检测出等位变异1 494个,平均每个SSR位点的等位变异为2.716 4,平均PIC值为0.445 0,其中30个多态性高的位点可作为评价大豆种质资源遗传多样性的重要位点;连锁群C1的多态性位点比例最高为0.961 5,连锁群A2的保守片断最多为11个,构建绥农14系谱亲本的指纹图谱最少需2个位点。50个表型性状共检测到等位变异255个,每个位点的平均等位变异为5.1个,平均PIC值为0.683 2,主成分分析结果表明,6个主成分的累积贡献率在80.1%以上,分析每个主成分的组成发现,产量性状、生长性状,品质性状、抗逆性状、固氮性状在分析大豆种质资源遗传多样性时均具有重要的作用,进行每一类性状的主成分分析,选出重要性状作为大豆综合性状考察的主要指标。基于SSR的UP-GMA聚类结果与基于农艺数据的UPGMA聚类结果的相关系数仅为0.393 0,2种聚类方法都只能在一定程度上揭示品种间的亲缘关系,因此,在进行种质资源遗传多样性研究时应将分子数据分析与表型性状解析相结合。

英文摘要:

Suinong 14 is the typical elite cultivar including high-quality,high yield,disease resistance and wide adaptability.Analysising the molecular and phenotypic genetic basis of Suinong 14 pedigree,provide the theoretical guidance in purposely chosing hybrid parent to broaden the genetic basis.In the current research,50 agronomic traits and 550 SSR markers were chosen and analyzed.According to nature of every trait,the 50 agricultural traits were adivided into 6 groups,growth traits,yield traits,quality traits,resistance traits.In total 1 494 alleles were detected in 550 SSR markers with an average allele number of 2.716 4 per locus,The average of PIC is 0.445 0,of which 30 high polymorphic loci can be chosed as important locis to evaluate the genetic diversity of soybean germplasm resources;LG C1 has the highest proportion of polymorphic loci of 0.961 5,LG A2 has the more conservative fragment up to 11.At least two SSR loci were needed to discriminate Suinong 14 from its pedigree.In total 255 alleles were detected in 50 phenotypic with an average allele number of 5.100 per locus,The average of PIC is 0.683 2.Principal component analysis(PCA) result showed that the cumulative contribute of 6 principal components for 50 agronomic traits was above 80.1%,Analysis of the composition of each priciple component show that every traits have an important role in the comprehensive study of genetic diversity of soybean germplasm.Some important traits of soybean were selected as key index in soybean study.The Correlation between SSR cluster and agronomic traits cluster basing on UPGMA is 0.393 0,the result indicated that the two kinds of clustering methods can only reveal some relationship among the species at a certain extent,Thus the optimal strategy combined SSR data and agronomic traits is necessary for genetic diversity analysis of soybean germplasm.

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962