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外显子周期性探究及自适应识别快速算法研究
  • ISSN号:1000-0984
  • 期刊名称:《数学的实践与认识》
  • 时间:0
  • 分类:O174.22[理学—数学;理学—基础数学]
  • 作者机构:[1]江西理工大学理学院,江西赣州341000
  • 相关基金:国家自然科学基金(11461032,11401267)
中文摘要:

外显子的3-周期性已被广泛的应用到基因识别中,而通过大量的实验表明并不是所有的已知外显子都表现出3-周期性,探究不同变换下外显子3-周期性的表现,得到自相关傅里叶变换可以增强外显子的3-周期性质;同时研究了不同数值映射之间在计算平均功率谱,N/3处功率谱和信噪比的关联,通过理论推导得到关联结果,进行仿真实验,并且结合Voss映射下的快速算法提出Z-curve映射下的快速算法,模拟不同DNA序列分别按照Z-curve映射下原始计算方法和快速算法计算相应的公式,实验结果证明快速算法的有效性和快速性,最后给出自适应窗口平移法识别外显子,利用评价指标,证明算法的实用性和可行性.

英文摘要:

This paper studies the association mapping between different numerical value mapping when calculating the average power spectrum, N/3 power spectrum and signal- to-noise ratio, which is obtained by theoretical derivation associated as a result, the use of simulation to prove the validity of the inference results. Combined with the fast algorithm of Voss mapping, Z - curve mapping of fast algorithm is put forward, different DNA sequences were simulated respectively in accordance with Z - curve mapping of the original calculation method and fast algorithm to calculate the corresponding formula, the experimental results demonstrate that the algorithm is effective and efficient.

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期刊信息
  • 《数学的实践与认识》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院数学与系统科学研究院
  • 主编:林群
  • 地址:北京大学数学科学学院
  • 邮编:100871
  • 邮箱:bjmath@math.pku.edu.cn
  • 电话:010-62759981
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0984
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2018/O1
  • 邮发代号:2-809
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国数学评论(网络版),德国数学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22973