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水稻粒宽基因GS5的功能标记开发和单倍型鉴定
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:《中国水稻科学》
  • 时间:0
  • 分类:S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏扬州225009
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31571624,31071382); 国家重点基础研究发展计划资助项目(2010CB125904,2013CBA01405); 江苏省高校自然科学研究重大项目(15KJA210004); 江苏省重点研发计划资助项目(BE2015341); 江苏高校优势学科建设工程资助项目
中文摘要:

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一,也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。在基因GS5序列分析的基础上,对该基因第2外显子的ACC/CTA和第9外显子A/C的两个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007-2013年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明,这两个变异位点的等位变异在水稻籽粒的粒长、粒宽和长宽比性状上存在显著或极显著的差异;其在水稻微核心种质中组成的4种单倍型在水稻籼亚种的粒宽、粒厚和长宽比性状上存在极显著的差异,在粳亚种的粒宽和长宽比性状上存在极显著的差异;而江苏省审定的粳稻品种中仅发现Hap1和Hap2两种单倍型,其分别有64个和1个代表性品种。这些研究结果为水稻产量和稻米品质育种中充分利用GS5的优异等位基因或单倍型奠定了基础。

英文摘要:

As a major component of rice grain shape,the grain width is an important trait which is correlated with the rice yield and quality.Based on the alignment of gene GS5 genomic DNA sequence,two functional markers were developed based on two missense polymorphisms(ACC/CTA in the exon2,A/C in the exon9,respectively).Subsequently,the markers were used to identify the genotypes of gene GS5 in the 294 accessions of a rice mini-core collection and 65 japonica varieties released in Jiangsu Province from 2007 to 2013.We found that the allelic variations at the two target loci had significant or extremely significant differences in the grain shape traits(grain length,grain width and ratio of length to width).Based on the two variation sites of gene GS5,four haplotypes(combinations)were found in the rice mini-core collection,and had extremely significant effect on grain width,grain thickness and ratio of length to width in the indica group,and on grain width and ratio of length to width in the japonica group,respectively.While in japonica varieties released by Jiangsu,only two haplotypes,Hap1(represented by 64varieties)and Hap2(represented by one variety)were found.The results will lay a foundation for the application of the useful allelic variations or haplotypes of gene GS5 to the rice yield and quality breeding program.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826