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RNA干涉对马铃薯内源酸性转化酶活性的影响
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学国家蔬菜改良中心华中分中心,教育部园艺植物生物学重点实验室,湖北省马铃薯工程技术研究中心,武汉430070
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30571181);国家863计划项目(2006AA100107)资助
中文摘要:

以4℃(Tester)和20℃(Driver)处理的马铃薯野生种Solanum berthaultii的无性系CW2-1块茎为材料,构建马铃薯块茎低温反应抑制差减文库以进一步筛选差异表达基因。通过PCR鉴定后,获得了含有2112个阳性克隆的差减杂交文库。采用反向Northern方法对差减文库进行筛选鉴定,得到274个含有显著表达差异基因(P/N〉3)的阳性克隆。从中挑选了53个克隆进行测序和同源比对分析,合并后获得29个代表不同基因的非重复序列片段,表明文库具有较高质量。随机选取其中4个EST进行基因表达分析,结果显示,在耐低温糖化的S.berthaultii块茎中,4℃下贮藏的块茎基因表达强度高于20℃贮藏的块茎;同在4℃贮藏条件下,S.berthaultii和易低温糖化栽培种E1的块茎中基因的表达量亦存在差异,证明所构建的差减文库富集了马铃薯块茎对低温响应的基因。

英文摘要:

A SSH(suppression subtractive hybridization) library was constructed to identify the genes of potato tubers response to low temperature,with wild species Solanum berthaultii CW2-1 tubers as material,which was treated at 4℃(Tester) and 20℃(Driver),respectively.A library including 2 112 positive clones was constructed by PCR identification.274 differentially expressed fragments(P/N〉3) were obtained through Northern blotting.Then 53 fragments were selected randomly for sequencing and homologous analysis.And 29 non-redundant gene fragments were acquired,which showed high quality of the library.Among them,4 ESTs(expression sequence tags) were selected randomly for further analysis.The results showed that the expression levels in the tubers of CW2-1 were higher at 4 ℃ than those at 20℃ by semi-quantitative reverse transcription PCR;while stored at 4℃,their expression levels were also different between CW2-1 and E1(E-potato 1,a potato cultivar sensitive to cold sweetening).This indicated that some cold-responsive genes in potato tuber were enriched by the SSH library constructed.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081