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内蒙古贝加尔针茅草原细菌多样性的PCR-DGGE分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:华北农学报
  • 时间:0
  • 页码:58-63
  • 语言:中文
  • 分类:S154.36[农业科学—土壤学;农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]农业部环境保护科研监测所,天津300191
  • 相关基金:国家自然科学基金(30770367); 中国农业科学院院长基金; 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2008-aepi-03)
  • 相关项目:贝加尔针茅草原土壤微生物多样性对放牧梯度的响应机制
中文摘要:

用Bourrain法、LaMontagne法、Zhou法、BBI.公司的试剂盒4种方法,比较研究了不同方法对内蒙古贝加尔针茅草原土壤基因组DNA的提取效果以及对后续分析的影响。用PCR-DGGE技术对贝加尔针茅草原土壤细菌群落结构进行分析,并对主要条带进行测序。结果表明:试剂盒法提取的DNA效果最好;贝加尔针茅草原土壤细菌主要由6个分支组成:变形菌门(Proteobacteria)中的α、δ、γ三个类群,放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),酸杆菌门(Acidobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)。

英文摘要:

This study compared the bacterial diversity from soil in Stipa baicalensis steppe by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis(PCR-DGGE) with four different DNA extraction methods.The DNArecover efficiency of the kit method was higher than others;further more the quality of DNA from kit is much better through analysis of the DGGE bands and sequencing the bands.The results suggested the microbial community in Stipa baicalensis steppe soil was mainly consisted of Actinobacteria,Proteobacteria,Bacteroidetes,Gemmatimonadetes,Acidobacteria,Verrucomicrobia.

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962