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单分子荧光成像研究凝血酶核酸适体的折叠
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O652[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]中国科学院化学研究所,北京100080
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:10334100,30490174,90406006)资助.
中文摘要:

通过对固定在表面的TMR标记凝血酶核酸适体进行单分子荧光成像,在单分子水平上研究了凝血酶核酸适体的折叠.在有K+存在的条件下,核酸适体分子与K+结合后发生折叠,形成G四分体结构,使得TMR靠近富含鸟嘌呤的G四分体,并与鸟嘌呤发生电子转移,从而导致TMR荧光强度降低.根据TMR的单分子荧光强度观察到不同K+浓度下核酸适体在折叠和无规卷曲两种状态下的分布.结果表明,可利用电子转移引起的荧光强度变化在单分子水平上研究核酸适体构象变化,这一新方法的建立是对常用的单分子荧光共振能量转移(FRET)法的重要补充.

英文摘要:

The folding of the thrombin DNA aptamer was studied with single molecule fluorescence imaging. The aptamer was singly labeled with TMR and immobilized on the glass surface. In the presence of K^+ , the folding of the aptamer resulted in the formation of G-quartets, thus brought TMR close to the guanosines. This led to the fluorescence decrease of TMR through the electron transfer between the dye and guanosines. From the fluorescence intensity of individual TMR, the distribution of aptamer molecules between the folded and random coil conformations was monitored at different concentrations of K^+. The results show a new approach for the investigation of aptamer conformational change by electron transfer induced fluorescence quenching, which is complementary to the commonly used fluorescence resonance energy transfer in single molecule study.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676