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荷包红鲤自噬相关基因LC3B的克隆及在重金属镉胁迫下的表达
  • ISSN号:1006-0464
  • 期刊名称:南昌大学学报(理科版)
  • 时间:2013.12.12
  • 页码:570-576
  • 分类:Q958.8[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]南昌大学医学院,江西南昌330006, [2]江西农业大学动物科学技术学院,江西南昌330045, [3]南昌大学免疫与生物治疗研究所,江西南昌330006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31001128);江西省自然科学基金项目(2010GQY0209);江西省科技支撑计划项目(2010BSB03001);江西省教育厅科学基金项目(GJJ11053);南昌大学(省级)创新创业训练计划项目(201310403036)。
  • 相关项目:金属硫蛋白对镉诱导鲤鱼细胞凋亡相关基因的调控机制研究
作者: 高典|
中文摘要:

微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,LC3)是哺乳动物细胞中酵母自噬相关基因8(ATG8)的同源物,其 LC3B亚型的表达强度与自噬泡数量的多少成正相关,为自噬发生的标志蛋白之一。应用 RACE-PCR技术克隆了婺源荷包红鲤 LC3B基因的 cDNA全长序列,用 RT-PCR方法检测了该基因在荷包红鲤主要组织中的表达,并用Real-time quantitative PCR方法检测了该基因在镉胁迫下转录水平的变化,以初步揭示该基因在镉胁迫下的作用。结果表明,荷包红鲤 LC3B基因 cDNA全长为2138 bp,其中开放阅读框长378 bp,编码125个氨基酸,预测分子量为14.73 kDa,等电点为8.76。序列比对显示,其编码的氨基酸序列和斑马鱼LC3B具有最高的一致性和相似性,并在系统发育树上聚为一支。该基因在荷包红鲤肌肉、脑、鳃、脾脏、肝脏、血液、头肾、肾脏和心脏组织中均有表达;在镉胁迫下,镉诱导显著影响了该基因在肾脏组织中的转录水平。LC3 B基因参与的自噬反应可能参与了抗镉毒性作用。

英文摘要:

LC3(microtubule-associated protein 1 light chain 3),located in autophagosome membranes after processing,serves as a major autophagy marker.In this study,we isolated its LC3B isform from common carp (cyprinus carpio),one of the most important industrial aquatic animals in China using rapid amplifica-tion of cDNA ends (RACE).The cDNA of LC3B gene is 2138-nt in length,containing a 378-nt open read-ing frame.The putative LC3B encodes a peptide of 125 amino acids,with a calculated molecular weight of 14.73 kDa and an isoelectric point of 8.76.Multiple sequence alignment showed that the deduced amino acid sequence of common carp LC3B had the highest sequence identity (95.2%)and similarity (96.8%)to that of zebrafish.In a phylogenetic tree based on amino acid sequences from fish,mammalian,avian and am-phibian LC3 genes,the LC3 proteins from different species were divided into three subgroups (LC3A, LC3B and LC3C).The common carp LC3B formed a phylogenetic cluster with zebrafish,then other verte-brates.The mRNA transcript level of LC3B was detected in muscle,brain,gills,spleen,liver,blood,head kidney,kidney and heart tissues by RT-PCR analysis.LC3B mRNA transcript level in kidney was found significantly elevated after exposure to cadmium.This was markedly affected by exposure concentration, not by exposure time.

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期刊信息
  • 《南昌大学学报:理科版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:南昌大学
  • 主办单位:南昌大学
  • 主编:谢明勇
  • 地址:南昌市南京东路235号南昌大学期刊社
  • 邮编:330047
  • 邮箱:NCDL@chinajournal.net.cn
  • 电话:0791-88305805
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-0464
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1193/N
  • 邮发代号:44-19
  • 获奖情况:
  • 2004年国家教育部优秀科技期刊,2006年首届中国高校特色科技期刊,2009年第四届华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5092