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虫草棒束孢类枯草杆菌蛋白酶基因克隆及分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S567.35[农业科学—中草药栽培;农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]重庆邮电大学生物信息学院,重庆600045, [2]重庆市中药研究院,重庆600045
  • 相关基金:国家自然科学基金(30901964,81072997,81173479);重庆市基础与前沿研究项目(cstc2015JA80006);重庆市基本科研业务费计划项目(2015este-jbky-01912);重庆市教委科学技术研究项目(KJ1500420,KJ130520);重庆市大学生创新创业训练计划项目(201610617103)
中文摘要:

采用逆转录PCR方法克隆获得1个虫草棒束孢类枯草杆菌蛋白酶基因的开放阅读框(ORF)序列,并对其进行生物信息学分析。该基因的开放阅读框全长1599bp,编码的蛋白质由532个氨基酸组成(包括18个氨基酸的信号肽)。预测蛋白质的等电点和分子量大小分别为6.256、56.936ku。进行序列分析和进化树构建,发现该蛋白酶与已知的几个种类枯草杆菌蛋白酶具有很高的同源性,且与虎甲寄生菌的粉拟青霉位于同一进化分支。实验首次鉴定了虫草棒束孢类枯草杆菌蛋白酶基因的编码区序列,为进一步研究虫草棒束孢致死蝙蝠蛾幼虫的作用机理提供理论依据。

英文摘要:

In the present study, the coding cDNA sequence oflsariafarinosa subtilisin-like protease ( IsSUB ) was cloned by reverse transcription PCR and analyzed by bioinformatieal tools in detail. The subtilisin contains 1 599 nucleotides with a putative open reading frame ( ORF ) encoding 532 amino acid residues ( with a signal peptide of 18 amino acid residues ) . The isoelectric point ( pI ) and predicted molecular weight of IsSUB were 6.256 and 56.936 kDa, respectively. Amino acid sequence and phylogenetic tree analysis among L farinosa and other insects represented that these fungal subtilisin had a high homology, and IsSUB existed in one evolutionary branching with Cicindelidac sp. Paecilomyces farinosus. It was concluded that the ORF of subtilisin-like protease from L farinosa provided theoretical basis for damaging on Hepialus larvae body wall.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995