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探索应用反向对接技术研究蛋白激酶抑制剂选择性的可行性
  • ISSN号:0513-4870
  • 期刊名称:药学学报
  • 时间:0
  • 页码:758-763
  • 语言:中文
  • 分类:R916[医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院,四川成都610065, [2]四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室,四川成都610041
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30772651,20872100).
  • 相关项目:新型选择性极光激酶A/B抑制剂的设计研究
中文摘要:

本文探索了应用反向对接技术研究激酶抑制剂选择性的可行性。首先通过收集晶体结构数据或使用同源建模方法建立了包含422个激酶的靶点三维结构数据库,在此基础上建立了反向对接激酶靶点筛选方法,并对相关参数和打分函数进行了优选。最后,选取了7个典型的选择性激酶抑制剂作为例子,用于测试该反向对接激酶靶点筛选方法。结果表明,这些激酶抑制剂的选择性作用靶点均具有较高的打分值(打分值均排在所测试激酶的35%以内)。本文的研究提示,反向对接技术可以应用于激酶靶点虚拟筛选,并进而应用于激酶抑制剂的选择性研究。

英文摘要:

This investigation is to explore the feasibility of applying reverse docking method to the selectivity studies of protein kinase inhibitors. Firstly, a database that consists of 422 protein kinase structures was established through collecting the reported crystal structures or homology modeling. Then a reverse docking based method of protein kinase target screening was established, followed by the optimization of related parameters and scoring functions. Finally, seven typical selective kinase inhibitors were used to test the established method The results show that the selective targets of these inhibitors have relatively high scoring function values (ranking in the first 35% of the tested kinase targets according to the scoring function values). This implies that the reverse docking method can be applied to the virtual screening of kinase targets and further to the selectivity studies of protein kinase inhibitors.

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期刊信息
  • 《药学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会 中国药学科学院药物研究所
  • 主编:王晓良
  • 地址:北京市先农坛街1号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:yxxb@imm.ac.cn
  • 电话:010-63026192
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-4870
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2163/R
  • 邮发代号:2-233
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双高”期刊,2002年为第2届国家期刊奖百种重点科技期刊并获第3...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37721