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人参生长素极性运输基因PIN的表达谱研究
  • ISSN号:0513-4870
  • 期刊名称:《药学学报》
  • 时间:0
  • 分类:R931[医药卫生—生药学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中国中医科学院中药资源中心,北京100700, [2]中国农业科学院特产研究所,吉林长春130112, [3]中国科学院北京基因组研究所,北京100101
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81603235);国家杰出青年科学基金项目(81325023);名贵中药资源可持续利用能力建设项目(2060302);中国中医科学院中药资源中心自主选题研究项目课题(ZZ2016006).
中文摘要:

生长素极性运输基因PIN(PIN-FORMED)决定了植物中生长素浓度梯度分布,参与多种发育及次生代谢过程。本研究采用转录组热图聚类方法分析了4年生吉林人参14个不同部位PIN2、PIN3及PIN6的表达谱,结果显示PgPIN2与PgPIN6主要在人参地下根与根茎中表达,PgPIN3在人参的叶子、果实及根中均有很高的表达;采用序列同源比对、RT-PCR扩增测序及生物信息学分析方法,确认了人参3个PIN基因成员PgPIN2、PgPIN3与PgPIN6;采用实时荧光定量PCR技术分析人参不定根、组培苗不同部位的表达模式,发现PgPIN3与PgPIN6在人参不定根根尖表达高,PgPIN2在人参组培苗根部表达高,PgPIN3在人参组培苗的叶中表达高。人参PIN基因的组织特异性表达表明PgPIN2、PgPIN3与PgPIN6对根的生长发育及向性生长很可能具有相应的功能,PIN3对人参植株地上部分的生长具有较重要的意义,可为后期深入挖掘其对人参向性生长等功能奠定基础。

英文摘要:

Polar auxin transport gene PIN (PIN-FORMED) determines the concentration gradient of auxin and plays an important role in development and secondary metabolism of plants. This study was designed to analyze the bioinformatics and expression of the PIN genes in Panax ginseng to explore a novel way of breeding ginseng varieties. Heatmap and cluster analysis of PIN2, PIN3, PIN6 was performed in four-year-old Jilin ginseng. Sequence homology alignment, RT-PCR amplification, sequencing and bioinformatics analysis were used to identify three PIN family genes PgPIN2, PgPIN3 and PgPIN6 in P ginseng. PIN expression in ginseng adventitious root and culture seedling was analyzed with qRT-PCR technique. Results suggested that in ginseng adventitious root tip, PgPIN3 and PgPIN6 exhibited a high level of expression; in ginseng culture seedling root, PgPIN2 showed a high level of expression; in four-year-old Jilin ginseng at the fruit ripening stage, PgPIN2 and PgPIN6 were highly expressed in root and rhizome, while PgPIN3 had a high level in ginseng leaf,fruit and root. Tissue specific expression profile showed that PgPIN2 and PgP1N6 probably were involved in the development and tropism growth in ginseng roots, while PIN3 might be in relation to the growth and development of the aerial part of plants.

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期刊信息
  • 《药学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会 中国药学科学院药物研究所
  • 主编:王晓良
  • 地址:北京市先农坛街1号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:yxxb@imm.ac.cn
  • 电话:010-63026192
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-4870
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2163/R
  • 邮发代号:2-233
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双高”期刊,2002年为第2届国家期刊奖百种重点科技期刊并获第3...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
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