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板栗丙酮酸磷酸双激酶基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:1001-7461
  • 期刊名称:《西北林学院学报》
  • 时间:0
  • 分类:S722.39[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:西南林业大学林学院,云南昆明650024
  • 相关基金:国家自然科学基金(30860231);云南省教育厅科学研究基金(2013y125).
中文摘要:

为探索板栗PPDK基因功能以及花粉直感效应分子机理,以板栗果实为材料,根据已登录的拟南芥、桃树、巨桉等多种其他植物物种的PPDK基因序列的保守区,设计特异性引物。利用RT-PCR技术克隆出板栗PPDK基因的编码区,并进行序列分析。结果表明,该基因长为3 293bp,包含一个完整的ORF,长2 676bp,编码892个氨基酸,分子量为97.89KDa。所编码的氨基酸序列与已知植物来源的若干PPDK基因相比,同源性大多在85%以上,证明所克隆的目的片段为PPDK基因,并将该序列登录到GenBank,登录号为KU234550。在PPDK基因所编码的氨基酸序列中发现了一个磷酸烯醇式丙酮酸利用酶磷酸化位点标记,一个拉链结构和多个磷酸化位点。同时推测出多肽链中有规则重复的构象,并同源建模PPDK蛋白整条肽链的三维空间结构。试验认为PPDK基因可能通过影响板栗光合作用进而使板栗在果实大小、淀粉含量等方面表现出明显的花粉直感效应。

英文摘要:

Through the test,a reference was provided for the studies on the function of pyruvate phosphate dikinase gene and metaxenia effect in Castanea mollissirna. Taking the fruit as materials, specific primers were designed on the basis of pyruvate phosphate dikinase (PPDK) gene from other plants in NCBI,PPDK gene was cloned and analyzed by RT-PCR techniques. A PPDK cDNA was cloned. The CDS length was 2676 bp,coding 892 amino acids, 97.8 KDa molecular weight. The sequence of PPDK had high similarity with other plants. GenBank accession number was KU234550. Besides, The PPDK contained some important motifs related with enzyme activities,such as Pyruvate phosphate dikinase,PEP/pyruvate binding domain,PEP-utilizing enzyme, mobile domain, a leucine zipper pattern and many phosphorylation sites. The secondary structure and tertiary structure were predicted. The studies suggested that chestnut showed obviously metaxenia effect on fruit size, starch content which may under the influence of PPDK on photosynthesis.

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期刊信息
  • 《西北林学院学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学
  • 主编:刘建军
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xlxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082059
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7461
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1202/S
  • 邮发代号:52-99
  • 获奖情况:
  • 2009 全国高校科技期刊优秀编辑质量奖,2008 第二届中国高校特色科技期刊,2006 中国农学会 中国期刊协会期刊分会 金犁奖...,2002 中国农学会全国优秀农业期刊一等奖,1999 教育部 全国优秀高校自然科学学报及教育部...,陕西省优秀科技期刊一等奖,陕西高校优秀学报一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:24548