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火龙果IRAP分子标记反应体系的建立与优化
  • ISSN号:1000-2421
  • 期刊名称:《华中农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S667.9[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]贵州大学农业生物工程研究院,贵阳550025, [2]贵州大学生命科学学院,贵阳550025, [3]贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳550006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31260464,31060256)和贵州省重大专项(20126006-01)
中文摘要:

基于火龙果Tyl-copia类反转录转座子的长末端重复序列信息设计引物,采用5因素4水平L16(4^5)的完全随机正交试验,对Mg计浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量、引物浓度和DNA含量进行优化,建立火龙果IRAP分子标记反应体系。结果表明,25弘L反应体系含基因组DNA20ng、2.5mmol/LMgCl2、0.10mmol/LdNTPs、10×PCRBuffer2.5μL、TaqDNA聚合酶0.75U、0.25μmol/LLTR引物,0.080g/mL的非变性PAGE胶适于IRAP多态性检测。

英文摘要:

Based on the LTR sequences of dragon fruit (Hylocereus spp. ) Tyl-copia retrotrans- posons, primers for IRAP were designed. The complete random orthogonal design L16 (45 ) was used to optimize the IRAP-PCR system at four levels and five factors, namely, Mg2+ , dNTP, Taq DNA polymerase, primers and DNA template. The results showed that the optimal system for IRAP amplification was 25 μL mixture containing 20 ng of template DNA,2.5 mmol/L MgCl2,0. 10 mmol/L dNTPs,2.5μL of 10× PCR Buffer,0.75 U of Taq DNA polymerase, 0. 25μmol/LLTR primer. PAGE with 0. 080 g/mL non-denaturing polyacrylamide gel could yield reproducible, clear and reliable bands, which facilitate the identification of dragon fruit germplasms,the elucidation of their genetic diversity as well as assessment of genetic variation.

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期刊信息
  • 《华中农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:华中农业大学
  • 主编:张献龙
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  • 邮编:430070
  • 邮箱:hnlkxb@mail.hzau.edu.cn
  • 电话:027-87287364
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2421
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1181/S
  • 邮发代号:38-120
  • 获奖情况:
  • 1997年,获第二届全国优秀科技期刊二等奖,1999年,获全国高校自然科学学报及教育部优秀期刊...,2001年,选入新闻出版署期刊方阵“双百”期刊,连续三次入选教育部中国高校精品科技期刊,2009年,获全车高校科技期刊优秀编辑质量奖,2010年,被评为湖北省十大有影响学术期刊(自然科...,2012年获“第四届中国高校优秀科技期刊奖”及“第...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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