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葱蝇PDK1基因的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号：1672-6693
  • 期刊名称：《重庆师范大学学报：自然科学版》
  • 时间：0
  • 分类：Q963[生物学—昆虫学]
  • 作者机构：[1]重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室
  • 相关基金：美国国立卫生研究院NIH项目(No.R01AI095184);国家自然科学基金(No.31071968;31372265);重庆市科技攻关重点项目(No.CSTC2012GG-YYJSB80002);“两江学者”计划专项经费;重庆市科委项目(No.CSTC2011BB1002)
作者： 申力[1], 郝友进[1], 罗钱春[1], 陈斌[1]
关键词： 葱蝇, PDK1基因, 克隆, 生物信息学分析
中文摘要：

3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1(3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1,PDK1)是磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphatidylinositol-3kinase,PI3K)/蛋白激酶B(PKB/Akt)信号通路中一个关键的激酶。该通路在人(Homo sapiens)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中是一条保守的通路,通过激活下游的因子对代谢、细胞分化、寿命等产生重要调节作用。本研究基于葱蝇(Delia antiqua)转录组数据通过生物信息学分析从其中鉴定出PDK1基因4条Unigene序列,并通过PCR技术克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为DaPDK1,其全长为3 215bp,开放阅读框长2 730bp,编码909个氨基酸。采用生物信息学的方法,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量为100.3kD,等电点为8.53。该蛋白第87~109氨基酸是跨膜区,第284~627和744~833氨基酸是两个保守结构域STKc和PH。同源性分析表明DaPDK1蛋白与地中海实蝇(Ceratitis capitata)PDK1蛋白氨基酸序列相似性最高(一致率为53.1%,相似率为63.2%)。本研究结果有望为进一步研究葱蝇PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础。

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期刊信息
  • 《重庆师范大学学报：自然科学版》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:重庆市教育委员会
  • 主办单位:重庆师范大学
  • 主编：杨新民
  • 地址：重庆市沙坪坝区
  • 邮编：400047
  • 邮箱：cqnuj@cqnu.edu.cn
  • 电话：023-65362431
  • 国际标准刊号：ISSN：1672-6693
  • 国内统一刊号：ISSN：50-1165/N
  • 邮发代号:78-34
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,瑞典开放获取期刊指南
  • 被引量:4584