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分子对接预测H5亚型禽流感病毒的广谱中和表位
  • ISSN号:0023-074X
  • 期刊名称:《科学通报》
  • 时间:0
  • 分类:S858.305.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医] S858.315.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心(厦门大学),厦门大学生命科学院,厦门大学细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室,厦门361005
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(批准号:30500092,30640017,30600106)、国家“十五”攻关项目(批准号:2004BA519A73)、国家科技支撑计划(批准号:2006BA101B06)、福建省重大科技专项(批准号:2004YZ01-1)和福建省重点科技项目(批准号:2005Y020)资助 致谢 感谢美国Scripps研究所的林天伟博士、新加坡国立大学的孔勇博士和韩晋华博士对本工作的指导和帮助.
中文摘要:

H5N1禽流感病毒已经在亚洲、欧洲和非洲广泛传播,造成了巨大损失.最近我们鉴定出一株对多种来源的H5N1代表株均有良好中和活性的、识别H5亚型血凝素(hemagglutinin,HA)的广谱单克隆抗体8H5,它对寻找克服禽流感高变性的广谱治疗性抗体、疫苗和药物具有重要价值.本研究应用分子模拟技术,采用“典范结构”方法对8H5抗体Fab片段进行结构模建,并通过能量分析、SAS值分析、“拉曼强传图”检验、profile-3D分析等理论验证,获得较为合理的8H5Fab的三维空间结构.8H5Fab与3种HA蛋白晶体结构的分子对接结果表明,8H5抗体与HA蛋白的作用模式与HA宿主来源无关,但与HA结构的亚型相似性相关.综合抗原同源比对结果,推测8H5抗体识别的广谱中和表位是由HA上的Asp^68,Asn^72,Glu^112,Lys^113,Ile^114,Pro^118,Ser^120,Tyr^137,Tyr^252。不连续氨基酸残基组成的构象表位.这一模型将为H5亚型禽流感病毒广谱疫苗和治疗性药物的分子设计提供依据.

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编:周光召
  • 地址:北京东黄城根北街16号
  • 邮编:100717
  • 邮箱:csb@scichina.org
  • 电话:010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号:ISSN:0023-074X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:81792