位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
丝带凤蝶线粒体基因组全序列及其系统学意义
  • ISSN号:0454-6296
  • 期刊名称:《昆虫学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q969[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]安徽师范大学生命科学学院分子进化与生物多样性研究室,安徽芜湖241000, [2]中国科学院动物研究所动物进化与系统学院级重点实验室,北京100101
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(41172004); 安徽省高校省级自然科学研究重点项目(KJ2010A142); 安徽省优秀青年科技基金(08040106811); 中国科学院动物研究所动物进化与系统学院级重点实验室专项基金(0529YX5105)
中文摘要:

锯凤蝶类与凤蝶科其他类群的系统发生关系及其分类学地位一直存在争议。本研究采用PCR和long PCR技术测定了属于锯凤蝶类的丝带凤蝶Sericinus montelus线粒体基因组全序列;结合已有的其他凤蝶科物种的相应序列数据,基于13个蛋白质编码基因重建了凤蝶科主要类群的系统发生树,探讨了它们之间的系统发生关系。基因组分析结果表明:丝带凤蝶线粒体基因组全长15242bp,包括13个编码蛋白基因(ATP6,ATP8,COⅠ-Ⅲ,ND1-6,ND4L和Cytb)、22个tRNA基因、16S和12SrRNA基因以及非编码的控制区;基因组A,T,G和C含量分别为40.1%,40.8%,7.4%和11.7%,表现出明显的AT偏倚。所有的蛋白质编码基因都使用标准的起始密码子(ATN);除ND4和ND4L基因使用单个的T作为终止密码子外,其余蛋白编码基因都使用了标准的终止密码子(TAA)。除丝氨酸tRNA的二氢尿苷突环缺失外,所有tRNA基因都形成典型的三叶草型结构。基因组中共存在12个大小介于2~65bp之间的基因间隔区以及15个大小介于1~8bp之间的基因重叠区,其中,存在于COⅡ和tRNALys之间的24bp的间隔区在其他鳞翅目昆虫中未曾见到。以邻接法和最大简约法并基于13个蛋白质编码基因序列对凤蝶科进行了系统发生分析。结果显示,丝带凤蝶和中华虎凤蝶Luehdorfia chinensis先构成一个支系,再和冰清绢蝶Parnassius bremeri构成姊妹群;表明锯凤蝶类应作为族级分类单元归于凤蝶科下的绢蝶亚科。

英文摘要:

The phylogenetic relationship between the zerynthiids and the other groups of Papilionidae has long been a controversial issue.In this study,the complete nucleotide sequences of the mitochondrial genome(mitogenome) of Sericinus montela belonging to the zerynthiids was determined using long PCR and conserved primer walking approaches.Meanwhile,the phylogenetic analysis of this species with other representative papilionid species was conducted to clarify their phylogenetic relationships on the mitogenomic level.The results showed that the entire mitochondrial DNA(mtDNA) molecule is 15 242 bp in length with the content of A,T,G and C of 40.1%,40.8%,7.4% and 11.7%,respectively,and its nucleotide composition of the genome is highly A+T biased(80.8%);all the 13 protein coding genes(PCGs) use standard initiation codons ATN,and all the PCGs use common stop codon(TAA),except for the ND4 and ND4L genes,which terminate with a single T;all tRNA genes form a typical clover-leaf secondary structure,except for the tRNASer(AGN),whose DHU arm forms a simple loop;there are twelve intergenic spacer regions ranging from 2 to 65 bp in size,and fifteen overlaps ranging from 1 to 8 bp in size in the mitogenome sequence.The neighbor joining and maximum parsimony phylogenetic analyses based on the 13 PCG sequences showed that Sericins montela and Luehdorfia chinensis form a clade that is sister to the Parnassius bremeri,suggesting that they should be designated as a taxon of tribal level within the subfamily Parnassiinae in the family of Papilionidae.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《昆虫学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:黄大卫
  • 地址:北京东中关村中国科学院动物研究所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:kcxb@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807173 010-64807099
  • 国际标准刊号:ISSN:0454-6296
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1832/Q
  • 邮发代号:2-153
  • 获奖情况:
  • 国家期刊方阵“双百期刊”
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16190