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活性污泥宏基因组Fosmid文库的构建
  • ISSN号:1000-565X
  • 期刊名称:《华南理工大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q93-33[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]大连理工大学工业生态与环境工程教育部重点实验室,辽宁大连116024
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(51078054,20923006)
中文摘要:

大插入片段宏基因组文库的构建是开发大片段目的基因及分析其结构与功能的基础.文中分别采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、试剂盒及琼脂糖包埋法提取活性污泥宏基因组DNA,其中琼脂糖包埋法获得的DNA片段大于23kbp,利用此DNA成功构建了以pCC1FOS为载体的Fosmid文库,该文库含有5280个克隆,平均插入片段长度为35~40 kbp,共包含约200 Mbp的宏基因组DNA.从此文库中随机挑选200个克隆,利用活性筛选方法快速筛选到了1个含有淀粉酶的阳性克隆,表明活性污泥Fosmid文库可用于功能基因的活性筛选,具有开发新基因的潜力.

英文摘要:

The construction of large-fragment metagenomic library helps to discover large-fragment functional genes and analyze their organization and function.In this paper,first,three methods,namely the CTAB method,the kit and the agarose-embedding method,were used to extract metagenomic DNA from activated sludge,and DNA fragments larger than 23 kbp were extracted by the agarose-embedding method.Then,the metagenomic DNA was ligated into pCC1FOS vector to construct a Fosmid library consisting of 5 280 clones with an average insert fragment size of 35~40 kbp,which covered about 200 Mbp of metagenomic DNA.Finally,one clone exhibiting amylase activity was rapidly screened from 200 randomly-picked clones via the activity-based screening.It is thus concluded that the Fosmid library constructed from activated sludge is feasible in the screening of novel functional genes by activity-based methods.

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期刊信息
  • 《华南理工大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家教育部科技司
  • 主办单位:华南理工大学
  • 主编:李元元
  • 地址:广州市天河区五山路华南理工大学17号楼
  • 邮编:510640
  • 邮箱:journal@scut.edu.cn
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-565X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1251/T
  • 邮发代号:46-174
  • 获奖情况:
  • 本学报荣获1996年国家教委系统优秀科技期刊二等奖...,1999年荣获全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀...,2001年荣获广东省优秀期刊奖和广东省优秀科技期刊...,2004年获全国高校优秀科技期刊二等奖,2006年获首届教育部优秀科技期刊奖,2008年荣获第二届教育部优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22954