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刚毛柽柳液泡膜H^+-PPase基因的克隆与胁迫下的表达分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨150040, [2]黑龙江省林业科学研究所,哈尔滨150081
  • 相关基金:国家自然科学基金(31300571); 教育部博士点基金(20130062120012)
中文摘要:

通过对刚毛柽柳转录组分析,鉴定获得1个液泡膜H^+-PPase基因的cDNA序列,命名为ThVP1。该cDNA序列全长3 022bp,开放阅读框为2 298bp,编码765个氨基酸,编码蛋白相对分子质量80.37kD,理论等电点5.25。ThVP1编码蛋白的疏水性较强,含有13个跨膜区。氨基酸多序列比对结果显示,ThVP1具有典型的液泡膜H^+-PPase家族3个高度保守片段(CS1、CS2和CS3),与大豆VP1氨基酸序列一致性最高,为93%。系统进化分析表明,ThVP1属于I型液泡膜H^+-PPase基因。实时荧光定量RT-PCR分析显示,NaCl和PEG胁迫下,ThVP1在柽柳根和叶中均呈现明显上调表达,表达量最高达到对照的20.9倍,暗示ThVP1可能在刚毛柽柳抗旱耐盐过程中发挥重要作用。

英文摘要:

A full length cDNA of a vacuolar H^+-PPase gene(named ThVP1)was isolated from the transcriptome cDNA librarys of Tamarix hispida.ThVP1 was 3 022 bp in length,including an open reading frame of 2 298 bp which was predicted to encode a polypeptide of 765 amino acids.The estimated molecular weight and isoelectric points of the putative protein were 80.37 kD and 5.25,respectively.Hydrophobicity analysis and transmembrane domain prediction indicated that the ThVP1 contained 13potential transmembrane domains with strong hydrophobicity.The amino acids sequence of ThVP1 contains three conservative domains(CS1,CS2 and CS3),which shows 93%identities in amino acids sequence to vacuolar H^+-PPase genes fromReaumuria trigyna.Phylogenetic analysis indicates that ThVP1 belongs to class I type vacuolar H^+-PPase gene.Quantitative real-time PCR assay revealed that the mRNA level of ThVP1 was significantly up-regulated by more than 20-fold higher than that of control under NaCl and PEG treatments in Tamarix hispida,suggesting that ThVP1 might play an important role in salt and drought tolerance of T.hispida.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104