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支持向量机方法预测离子通道蛋白
  • ISSN号：1672-9722
  • 期刊名称：《计算机与数字工程》
  • 时间：0
  • 分类：TP391.41[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构：[1]华中科技大学生命科学与技术学院,武汉430074
  • 相关基金：国家自然科学基金项目（编号：90203011）资助.
作者： 涂白[1], 毕然[1]
关键词： 离子通道, 结构域, 支持向量机, 基因本体
中文摘要：

讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白。通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较。通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%。

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期刊信息
  • 《计算机与数字工程》
  • 主管单位:中国船舶重工集团公司
  • 主办单位:中船重工集团公司七院第七0九研究所
  • 主编：王小非
  • 地址：武昌74223信箱
  • 邮编：430074
  • 邮箱：jssg@chinajournal.net.cn
  • 电话：027-87534308 87534205
  • 国际标准刊号：ISSN：1672-9722
  • 国内统一刊号：ISSN：42-1372/TP
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  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:13630