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禾谷镰刀菌致病性蛋白CYP51C cDNA克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1001-4942
  • 期刊名称:《山东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]青岛农业大学动漫与传媒学院,山东青岛266109, [2]青岛农业大学农学与植物保护学院/山东省植物病虫害综合防控重点实验室,山东青岛266109
  • 相关基金:国家自然科学基金项目“禾谷镰刀菌CYP51蛋白抗药性分子机制”(31471735); 国家科技基础条件平台子项目“林业经济微生物资源标准化整理、整合”(2005DKA21207-17); 山东省“泰山学者”建设工程专项经费; 青岛农业大学高层次人才科研基金项目(631217)
中文摘要:

本研究采用RT-PCR技术,克隆获得禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)致病性CYP51C蛋白基因c DNA序列,并对蛋白氨基酸序列进行生物信息学分析,明确其序列典型特征。结果表明:其c DNA序列全长为1 554 bp,编码517个氨基酸;该蛋白分子量为58.6 k D,等电点为6.36;含有细胞色素P450家族成员典型的保守结构域;不具有信号肽,属于非分泌性蛋白;具有跨膜结构域,是亲水性蛋白;蛋白质二级结构最主要的结构元件是α螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测显示CYP51C蛋白主要位于细胞质中。这些研究结果为蛋白纯化及其蛋白结构生物学研究提供参考,进而可为病原真菌药物靶标设计奠定基础。

英文摘要:

In this study,the full -length cDNA sequence of pathogenic protein CYP51C from Fusarium graminearum was cloned using RT -PCR,and the bioinformatics analysis of amino acid sequences was con-ducted and its typical characteristics was identified.The results showed that the full -length cDNA sequence of CYP51C included a complete open reading frame (ORF)of 1 554 bp,which encoded 517 amino acids.Its molecular weight was 58.6 kD and its isoelectric point was 6.36.It possessed the conserved domains which were characteristics of cytochrome P450 family members.It was not a secretory protein without a signal pep-tide,but was a hydrophilicity protein with transmembrane domain.The major structural elements of polypep-tide chain were α-helix and random coil.Subcellular localization result indicated that CYP51C was mainly located in cytoplasm.These results would provide references for the study on protein purification and protein structural biology,and then lay a foundation for drug design targeting pathogenic fungi.

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期刊信息
  • 《山东农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:山东农业科学院
  • 主办单位:山东省农业科学院 山东农学会 山东农业大学
  • 主编:万书波
  • 地址:济南市工业北路202号
  • 邮编:250100
  • 邮箱:sdnykx@saas.ac.cn
  • 电话:0531-83179268
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-4942
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1148/S
  • 邮发代号:24-2
  • 获奖情况:
  • 山东十佳期刊,华东地区最佳期刊,全国优秀科技期刊,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊
  • 被引量:18782