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基于密码子偏性的置换模型估计正向选择
  • ISSN号：1001-9626
  • 期刊名称：《生物数学学报》
  • 时间：0
  • 分类：O157.4[理学—数学;理学—基础数学]
  • 作者机构：[1]南京航空航天大学航空宇航学院理学院
  • 相关基金：国家自然科学基金(61374183,10971097)
作者： 张丽丽[1], 刘心声[1]
关键词： 极大似然估计, 密码子置换模型, 密码子使用偏性, 正向选择
中文摘要：

由于遗传密码子的简并性特征,大多氨基酸由多于一种密码子编码.在蛋白质编码过程中,同义密码子间的使用有着较显著的偏差,即同义密码于使用频率不等.应用CUSP软件对数据集H3N2和MHC进行同义密码子使用偏性的分析,然后基于同义密码子的使用偏性建立新的密码子置换模型,并在此模型的基础上分析物种的正向选择性.分析结果表明新的密码子置换模型能更好地拟合数据,由此可得到更加可靠的参数估计值.

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期刊信息
  • 《生物数学学报》
  • 北大核心期刊（2008版）
  • 主管单位:中国数学会
  • 主办单位:中国数学会生物数学学会
  • 主编：陈兰荪
  • 地址：辽宁省鞍山师范学院158号
  • 邮编：114007
  • 邮箱：smbjbm@tom.com
  • 电话：0412-2960893
  • 国际标准刊号：ISSN：1001-9626
  • 国内统一刊号：ISSN：34-1071/O1
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国数学评论（网络版）,德国数学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）
  • 被引量:5686