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基于人类信号转导网络研究卵巢癌病变过程的信号转导模式
  • ISSN号:1000-6737
  • 期刊名称:《生物物理学报》
  • 时间:0
  • 分类:R318.04[医药卫生—生物医学工程;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]同济大学生命科学与技术学院,上海200092, [2]上海生物信息技术研究中心,上海200235, [3]中国科学院上海生命科学院生化与细胞研究所,系统生物学重点实验室,上海200031, [4]华东理工大学生物工程学院,上海200237
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31171268,81272279,91229106),上海市科委基础研究项目(14DZ1951300,14DZ2252000)
中文摘要:

为了系统地研究卵巢癌病变过程的信号转导模式,综合多种信息构建了完整的人类信号转导网络,发现卵巢癌相关基因在网络中的拓扑学性质与其它基因存在显著差异。将正常、早期卵巢癌和晚期卵巢癌三种状态下的基因表达谱数据映射到信号转导网络中,利用基于共表达改变量的方法,筛选出正常与早期卵巢癌、正常与晚期卵巢癌、早期卵巢癌与晚期卵巢癌间的显著差异模体。通过对显著差异模体进行功能和模式的分析,发现卵巢癌的发生发展主要和信号级联模式的异常相关。另外,还发现AR、PAK6和KPNB1三个基因间信号转导模式的异常和卵巢癌的恶化相关。

英文摘要:

In order to understand the signal transduction mode of the deterioration of ovarian cancer in a systematic level, a comprehensive human signal transduction network was constructed base on several databases. Topological analysis of ovarian cancer genes showed that they had significantly different topological properties compared with others in the network. Then the authors mapped the gene expression data of ovarian cancer in normal, early and advanced stages to the signal transduction network, and detected significantly changed motifs in normal vs. early, normal vs. advanced, and early vs. advanced stages by using the co-expression changed method. After analyzing the functions and modes of the significantly changed motifs, they found that the development of ovarian cancer was mainly related to the dysfunction of the cascading signal transduction mode, and what is more, the abnormal of the signal transduction among AR, PAK6 and KPNB1 associates with the deterioration of ovarian cancer.

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期刊信息
  • 《生物物理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国生物物理学会
  • 主编:沈恂
  • 地址:北京朝阳区大屯路15号生物物理研究所内
  • 邮编:100101
  • 邮箱:acta@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888458
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6737
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1992/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 二次获得中国科协优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:7189