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采用全基因组扫描法定位影响猪后腿质量QTL
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医] Q343.17[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]江西农业大学动物生物技术国家重点实验室培育基地,南昌330045
  • 相关基金:国家杰出青年基金项目(30425045);973前期专项(2006CB708213)致谢:感谢江西农业大学任军博士对论文的修改;感谢参与江西农业大学动物生物技术国家重点实验室培育基地白色杜洛克×二花脸资源家系构建的所有老师和研究生.
中文摘要:

为研究影响猪后腿质量的QTL,采用分布于猪全基因组19对染色体上的183个微卫星标记,对白色杜洛克(♂)×二花脸(♀)资源家系群体1 028头F2代个体及其亲本进行基因型检测,利用最小二乘线性回归分析,通过置换试验确定显著性域值,对影响猪后腿质量的数量性状位点(QTL)进行了定位分析。共检测到10个QTL位点,其中在猪2、4、7、8、18号染色体上检测到5个1%基因组显著水平的QTLs,在5和7号染色体上检测到2个5%基因组显著水平QTLs。影响效应最大的QTL位于7号染色体58 cM处,置信区间仅为5 cM,这些结果为下一步的精细定位和位置候选基因的分离奠定了基础。

英文摘要:

To detect the QTL for ham weight (HW), a total of 1 028 F2 animals at 240 days of age from a White Duroc× Erhualian resource population were measured for phenotypic data. All F2 individuals and their parents and grandparents were genotyped for 183 informative mierosatellite markers on 19 pairs of porcine chromosomes. Quantitative trait loci (QTL) for ham weight were identified by using an interval mapping method based on least-squares regression. The threshold values of significance were determined empirically by a permutation test. In total, 10 QTLs were detected including five 1% genome-wide significant QTLs on pig chromosomes (SSC) 2, 4, 7, 8 and 18 and two QTLs at the 5% genome-wide significant level on SSC5 and SSC7. The most significant QTL was found at 58 cM on SSC7 with a confidence interval of 5 cM. The results provide a start point to refine the QTLs for the interest traits and isolate positional candidate genes.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857