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紫花苜蓿抗逆基因MsDUF的克隆及其功能分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:中国农业科学
  • 时间:0
  • 页码:424-432
  • 分类:S541.9[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100, [2]旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30901050,31272490); 国家“十二五”科技支撑计划(2011BAD17B05)
  • 相关项目:根瘤菌共生提高苜蓿抗旱性的差异基因分析
中文摘要:

【目的】克隆紫花苜蓿(Medicago sativa L.)抗逆新基因MsDUF,并对其进行序列特征分析,了解该基因在逆境胁迫下的表达模式。【方法】利用RACE法获得紫花苜蓿MsDUF全长的cDNA序列,对该序列进行生物信息学分析;用基因枪法进行MsDUF的亚细胞定位分析;采用实时荧光定量PCR研究该基因在高含量NaCl和PEG-6000的胁迫下,以及ABA和GA3诱导下的表达模式。【结果】测序结果显示,该基因cDNA全长714 bp,包含一个633 bp的完整开放阅读框,编码210个氨基酸,命名为MsDUF,GenBank登录号为JX183734。氨基酸BLASTP分析表明,MsDUF氨基酸序列与拟南芥、大豆和蒺藜苜蓿等具有53%—98%的相似性,属于DUF4228 superfamily。实时荧光定量PCR研究表明,该基因在逆境胁迫下上调表达。【结论】从紫花苜蓿中克隆了抗逆相关基因MsDUF,发现其定位于细胞质中,实时荧光定量PCR结果分析表明该基因在紫花苜蓿的抗逆反应中起着重要作用。

英文摘要:

[Objective] This study is aimed to characterize the stress resistance gene MsDUF in Medicago sativa by cloning and analysis of its sequence, and study the function of MSDUF under stress conditions. [Method] The full-length cDNA sequence of MsDUF was isolated by RACE. The obtained cDNA sequence and the deduced amino acid sequence were analysed. Using gene gun in subcellular localization. Real-time quantitative PCR was used to assess the expression of MsDUF in response to NaC1, PEG-6000, ABA and GA3. [Result] The sequencing result showed that the cloned cDNA (designated as MsDUF, GenBank accession No. JX183734) was 714 bp, contains an open reading frame (ORF) of 633bp, and encoding a protein with 210 amino acids. BLASTp search revealed 53% to 98% similarities between the MSDUF protein and those reported MSDUF from other species, such as Arabidopsis thaliana, Glycine max and M.. truncatula, The RT-PCR result showed that MsDUF was upregulatedly in response to stress resistance. [Conclusion] The stress resistance related gene MsDUF was cloned from M. sativa and found that it localized in cytoplasm. RT-PCR analysis showed that the gene MsDUF plays an important role in response to the abiotic stress. It is a novel stress resistance gene in M. sativa.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620