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广西1985年~2008年IBV分离株S1基因高变区I和N基因的序列和系统进化分析
  • ISSN号:1008-0589
  • 期刊名称:《中国预防兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.61[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530004
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30700599);广西自然科学基金(桂科青0728003);广西自然科学基金(桂科自0991044);广西科技攻关项目(0993009-2)
中文摘要:

为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白s1基因高变区I(HVRI)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT.PCR方法扩增了广西1985年-2008年的21株IBV的s1基因HVRI和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。结果发现:广西存在着多种基因型IBV流行;广西IBV分离株s1基因存在广泛的点突变和插入现象;N基因序列存在氨基酸替代现象。21株IBV中12株在s1基因HVRI和N基因遗传进化树中均归属相同群,其余毒株却归属不同的群。2005年分离的GX.NN5存在基因重组现象。以上结果表明了广西IBV毒株存在基因突变和基因重组现象,s1和N基因的变异不完全平行,有些毒株间的S1和N基因差异很大。

英文摘要:

To investigate genetic variations of S1 gene hypervariable region I (HVR I) and nucleocapsid (N) protein genes, S1 gene HVR I and N genes of 21 infectious bronchitis virus (IBV) strains isolated in Guangxi province of China between 1985 and 2008 were amplified by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), cloned and sequenced. The results showed that there were multi-genotypes IBVs prevailed in Guangxi province of China. Relatively high frequency of point mutations and insertions occurred within the S1 gene. Several amino acid substitutions were also found in the N protein gene sequences. Among all IBV strains, 12 belonged to the same genotype based on the deduced amino acid sequences of both S1 and N gene; others belonged to the different genotypes.

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期刊信息
  • 《中国预防兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
  • 主编:步志高
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路678号
  • 邮编:150001
  • 邮箱:zgyfsyxbhvri@163.com
  • 电话:0451-51051811 51051812
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0589
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1417/S
  • 邮发代号:14-70
  • 获奖情况:
  • 全国农业优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12844