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空肠弯曲菌主要外膜蛋白OMP18的B细胞抗原表位分析及功能鉴定
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:R378[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]金华职业技术学院人畜共患病研究所,金华321007, [2]金华市中心医院,金华321000
  • 相关基金:浙江省公益性技术应用研究计划资助项目(No.2013C33215),金华市科技研究计划资助项目(No.2013-3-017)和浙江省医药卫生计划资助项目(No.2013KYA214)共同资助
中文摘要:

目的:从生物信息学角度了解空肠弯曲菌主要外膜蛋白OM P18的跨膜结构、B细胞抗原表位及其抗原性、基因序列保守性等特征,并鉴定空肠弯曲菌主要外膜蛋白优势B细胞抗原表位,为后续抗体检测和疫苗研究提供实验依据。方法使用NCBI/Blast ,TMHMM Server V2.0,DNA Star等生物信息学分析软件对空肠弯曲菌主要外膜蛋白OMP18进行蛋白跨膜结构预测、线性B细胞抗原表位及其抗原性分析、并对不同空肠弯曲菌OM P18蛋白的氨基酸序列同源性进行比较。采用空肠弯曲菌全菌抗体IgG为一抗,基于ELISA技术对优势线性B细胞抗原表位进行筛选鉴定。结果生物信息学预测结果表明外膜蛋白OM P18定位于空肠弯曲菌外膜且不存在跨膜结构。蛋白序列保守存在于各空肠弯曲菌株中,序列同源性达95%以上。同时,我们发现该外膜蛋白中存在3个明显的B细胞线性表位,且具有很强的抗原性。ELISA检测鉴定结果表明3个B细胞抗原表位都能有效识别空肠弯曲菌全菌抗体。结论空肠弯曲菌主要外膜蛋白OMP18保守存在于细菌表面,存在3个重要的B细胞线性抗原表位,可用于后续的抗体检测和疫苗开发研究。

英文摘要:

In this study ,we aimed to understand the sequence characteristics ,transmembrane structures ,line B cell epitopes present in the OMP18 from Campylobacter jejuni ,and provide candidate antigens for the antibody detection and vaccine development .NCBI/Blast ,TMHMM Server V2 and DNA Star softwares were used for the OMP18 sequence analysis . Based on the ELISA ,the whole bacterial antibody IgG of Campylobacter jejuni was used for the identification of the predicted line B cell epitopes .The OMP18 gene was found conserved in different Campylobacter jejuni strains .The OMP18 was predicted to be located on the outer surface of the bacteria .And three line B cell epitopes were determined to be present in the OMP18 protein .As a conclusion ,the OMP18 protein was confirmed to be an important outer membrane protein ;three line B cell epitopes were identified in the OMP18 ,which could be further used for Campylobacter jejuni antibody detection and vaccine development .

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000