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罗布泊盐湖沉积物放线菌的群落结构
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]西华大学生物工程学院,成都610039, [2]塔里木大学,阿拉尔843300, [3]四川农业大学资源环境学院,成都625000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(Nos.31060003,31060001); 教育部春晖计划项目(No.Z2012022); 西华大学重点科研基金项目(No.Z1220530); 教育部科学技术重点项目(No.20 9145)共同资助
中文摘要:

为开发盐湖生态放线菌资源,应用16S rRNA基因文库构建和序列的系统发育分析对罗布泊盐湖沉积物中放线菌的群落结构进行了研究.结果显示罗布泊盐湖放线菌群落组成丰富,共获得Ilumatobacter、Saccharopolyspora、Streptomyces、Actinopolyspora、Kocuria、Streptomonospora、Streptosporangium、Amycolatopsis、Isoptericola、Nocardiopsis、Dietzia和Glycomyces共12个属的放线菌;罗布泊盐湖中存在有大量放线菌新类群,58.82%克隆的序列与有效命名的菌株同源性≤97%,其中36.78%的序列与有效命名的菌株的同源性低于90%而无法归入任何一个属,预示着可能是一些科一级或更高的新的放线菌分类单元.罗布泊放线菌群落中占优势的菌群为Glycomyces(20.10%)、Dietzia(16.13%)、Isoptericola(10.30%)和Nocardiopsis(5.88%),而不是链霉菌Streptomyces(1.47%).研究表明盐湖生态存在丰富的放线菌资源和新类群,从而为其开发提供了理论数据.

英文摘要:

To explore and exploit actinomycetes from salt lake ecosystem, actinobacterial community structure in a sediment sample from Lop Nur Salt Lake in Xinjiang was investigated with 16S rRNA gene library, The results showed that the retrieved clones belonged to 12 genera in the Acidimicrobidae, Acidimicrobidae and Nitriliruptoride, namely llumatobacter, Saccharopolyspora, Streptornyces, Actinopolyspora, Kocuria, Streptomonospora, Streptosporangium, Amycolatopsis, Isoptericola, Nocardiopsis, Dietzia and Glycomyces. In addition, abundant novel actinobacterial 16S rRNA sequences were detected in the salt lake sediment. We found 58.82% clone sequences exhibited low similarity (〈 97.0%) to other species of the Acidimicrobidae, indicating novel actinobacteria taxa. Some of the clones (36.78%) exhibited lower similarity (〈 90.0%) among Phylum Actinobacteria which may represent some new suborder or new class. The most abundant and diverse clones were the Glycomyces (20.10%), Dietzia (16.13%), Isoptericola (10.30%) and Nocardiopsis (5.88%), respectively, not the universal Streptornyces (1.47%). These findings provided data for resource exploitation. Fig 3, Tab 3, Ref 23

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016