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实时荧光定量PCR检测沙门菌flor基因和sul2基因方法的建立
  • ISSN号:1001-8689
  • 期刊名称:《中国抗生素杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R378[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽省畜禽产业共性研究院,合肥230036
  • 相关基金:安徽农业大学学科学位点建设项目(No.XKXWD2013006)和安徽农业大学大学生创新基金项目(No.2011053)
中文摘要:

目的建立一种flor基因和sul2基因的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,为检测沙门菌的耐药性以及耐药基因分子流行病学调查奠定基础。方法以氟苯尼考、复方磺胺甲嗯唑抗性的沙门菌菌株为材料,根据GenBank中登陆的沙门菌flor和sul2基因序列,设计并合成引物,建立基于SYBR Green I染料技术的Real-Time PCR检测体系,绘制出标准曲线并对其溶解曲线进行分析。结果以pMD18-T为载体构建的标准品的Ct值与样品的浓度的对数在一定范围内呈现良好的线性关系,两基因的检测域值较小,flor基因可以检测到10^2 copies/μL的样品,sul2基因可以检测到10^3 copies/μL的样品,经耐药性与基因表达量相关分析,耐药性较高的菌株其flor基因、sul2基因表达量也较高。结论建立的检测沙门菌中flor基因和sul2基因的荧光定量PCR方法具有很好的灵敏性、特异性和重复性,可以广泛用于临床中flor和sul2两种基因的检测以及沙门菌耐药分子流行病学的调查。

英文摘要:

Objective To establish a SYBY Green I real-time quantity PCR mothed to detect theflor and sul2 genes and lay foundations for detect the resistance of Salmonella and molecular epidemiological survey. Methods Salmonella resistance to florfenicol and trimethoprim and sulphame-thoxazole was material. According to the Salmonellaflor gene and sul2 gene sequence in GenBank, the specific primers were designed and synthesized, then established the Real-Time PCR SYBR Green I detection system on the techology of SYBR Green I dye. Results The Ct value of standard constructed by pMD 18-T vector has a good liner relationship with the logarithm of concentrains of the standard in a certain range. The dection threshod of two genes were small, forflor gene, 10^2copies/μL can be detected, for sul2 gene, 10^3copies/μL can be detected, the drug resistance and gene expression analysis shows the higher sistance strains offlor and sul2, the gene expression was higher. Conclusion The methods were established for detectflor and sul2 genes has good sensitivity, spectificity and reproducibility, it can be used in clinical detection offlor and sul2 genes and investigation of Salmonella resistant molecular epidemiology.

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期刊信息
  • 《中国抗生素杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国医药集团总公司
  • 主办单位:中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所 中国医学科学院医药生物技术研究所
  • 主编:刘昌孝
  • 地址:四川成都市成华区龙潭都市工业集中发展区华冠璐168
  • 邮编:610052
  • 邮箱:cjap@163.com
  • 电话:028-84618674
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-8689
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1126/R
  • 邮发代号:62-193
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17918