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SEFA—PCR法克隆灵芝鲨烯合酶基因启动子及其序列分析
  • ISSN号:1672-6472
  • 期刊名称:《菌物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.96[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金(30300006,30571294)和江苏省自然科学基金创新人才项目(BK2006517)资助
中文摘要:

鲨烯合酶是灵芝三萜生物合成的关键酶,灵芝鲨烯合酶基因的表达和活性的高低决定了灵芝中三萜含量的高低。根据已经获得的灵芝鲨烯合酶全长eDNA序列设计一对专一引物,通过PCR扩增得到了灵芝鲨烯合酶基因的基因组全长,序列长1984bp,含有3个内含子。根据其基因组序列设计引物,采用SEFA-PCR的方法,以总DNA为模板,克隆了灵芝鲨烯合酶基因的启动子序列,长1042bp。序列分析发现灵芝鲨烯合酶基因启动子中没有明显的TATA和CAAT框,但是含有CCAAT-bindingfactor、GATA-1、GC-box、TFIID等重要的转录因子的结合位点,以及在人和酿酒酵母鲨烯合酶基因启动子中发现的甾醇调节相关的顺式调控元件。

英文摘要:

Squalene synthase is the key enzyme in triterpene biosynthesis of Ganoderma lucidum. There is a positive correlation between the expression level of squalene synthase and the amount of triterpenes produced. The full length of G lucidum squalene synthase gene was cloned by PCR according to the eDNA sequence. The sequence consisted of 1984bp, containing three introns. Using the SEFA-PCR method, the promoter sequence of G lucidum squalene synthase was amplified from G. lucidum genomie DNA. Nueleotide sequence analysis showed that the fragment cloned consisted of 1042bp. The promoter was analyzed using the Softberry software. The results showed that it contained several regulatory elements, such as CCAAT-binding factor, GATA-1, GC-box, TF II D, but the TATA box and the CAAT box could not be found. The promoter contains sterol regulatory elements and is similar to that of human and Saccharomyces cerevisiae.

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期刊信息
  • 《菌物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国菌物学会
  • 主编:戴玉成
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
  • 邮编:100101
  • 邮箱:jwxt@im.ac.cn
  • 电话:010-64807521
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6472
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5180/Q
  • 邮发代号:2-499
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5637