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西藏藏族15个STRs位点多态性及其与其他民族群体的遗传关系
  • ISSN号:1672-7347
  • 期刊名称:《中南大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]西藏民族学院医学系,陕西咸阳712082, [2]西藏职业技术学院,拉萨850030, [3]西藏大学医学院病理学教研室,拉萨850000
  • 相关基金:国家自然科学基金(30760097). 致谢:非常感谢DNA的供者和帮助收集样本的研究者,同时感谢两位审稿专家对文章所提的建议;感谢复旦大学生命科学院李士林老师和徐书华老师在数据处理和软件分析方面提供的指导和帮助.
中文摘要:

目的:研究西藏藏族人群15个短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)位点(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,vWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA)的多态性分布及群体遗传学和法医学应用价值。并分析它们与西藏其他民族及其他亚洲人群间的遗传学关系。方法:采用ABI3100遗传分析仪检测STRs基因多态性,用ARLEQUIN 3.1软件计算等位基因频率和各种多态性参数。并将其结果与文献报道的其他亚洲人群的STRs结果进行比对,DISPAN软件计算遗传距离(DA)、基因分化系数(Gst)和杂合度(Ht),MEGA4.0软件绘制进化树,SPSS14.0进行多维量表法(MDS)分析。结果:藏族群体中共检出132种等位基因,频率分布0.0050-0.5990;杂合度、个体识别力、多态性信息量等群体遗传学指标分析显示,15个STRs位点具有中度或高度多态性,中国藏族群体具有较独立的遗传结构。结论:所选择的15个STRs位点具有较高的个体识别力和多态性信息量,可用于群体遗传学和法医学研究。

英文摘要:

Objective To determine the genetic diversity of short tandem repeats ( STRs ) loci (D8S1179, D21S11, D7S820, CSFIPO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, vWA; TPOX, D18S51, D5S818, and FGA ) , and to evaluate the genetic structure of Tibetan nationality and its affinity with other Tibetans (Changdu Tibetan, Luoba ethnic group, Deng population ) and other Asian populations. Methods Fifteen STRs loci were amplified simultaneously using a multiplex PCR typing system. Amplified STR fragments were analyzed with an ABI PRISM 3100 Avant DNA Analyzer. Arlequin software version 3. 1 was used to obtain allele frequencies and polymorphism parameters. The genetic distance ( DA ) , coefficient of gene differentiation (Gst) values, and heterozygosity (Ht) were estimated using DISPAN. A phylogenetic tree from the allele frequency data at 8 STRs loci and 15 STRs loci obtained from the literature reported previously by using the DA and Neighbor-Joining (N-J) method was constructed using MEGA Version 4. 0. Multidimensional scaling ( MDS ) analysis was performed using the SPSS 14.0 software package. Results We got 132 alleles in the population -studied, with the frequency of 0. 0050 - 0. 5990. Ht, the power of discrimination ( DP ) and the polymorphism information content ( PIC ) were consistent with the forensic application. Cluster analysis and phylogenic trees revealed that Tibetan nationality had estrangement genetic affinity with other Chinese nationalities and Asian population. Conclusion The genetic information demonstrates that the 15 chosen gene makers are highly informative loci and are suitable for population genetic research and forensic application.

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期刊信息
  • 《中南大学学报:医学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中南大学
  • 主编:李桂源
  • 地址:湖南省长沙市湘雅路110号 中南大学湘雅医学院75号信箱
  • 邮编:410078
  • 邮箱:xyxb2005@vip.163.com xyxb2005@126.com
  • 电话:0731-84805495 84805496
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-7347
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1427/R
  • 邮发代号:42-10
  • 获奖情况:
  • 省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,1992、1996年,中国生物医学核心期刊,中国期刊方阵双效期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11694