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运用SYBR GreenⅠ荧光实时RT-PCR法检测草莓中甲肝病毒
  • ISSN号:1002-6630
  • 期刊名称:《食品科学》
  • 时间:0
  • 分类:R373.2[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学] TS207.5[轻工技术与工程—食品科学;轻工技术与工程—食品科学与工程]
  • 作者机构:[1]暨南大学药学院基因组药物研究所,广东广州510632, [2]广东检验检疫技术中心,广东广州510623
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30872221); 广东省农业攻关科技计划项目(2005B20401017); 广东出入境检验检疫局科技计划项目(2005AGDK28)
中文摘要:

针对甲肝病毒的vp3/vp1壳蛋白区域设计引物,建立SYBR GreenⅠ实时荧光RT-PCR检测甲肝病毒的反应体系。此方法的病毒检测下限达到101TCID50,标准曲线为Ct=-3.052lg(TCID50)+34.57,线形范围101~105TCID50,相关系数0.9961。该方法对甲肝病毒检测特异,与轮状病毒、腺病毒、诺如病毒、星状病毒无交叉反应。针对甲肝病毒标准品检测的批内试验变异系数(CV)为0.85%~1.71%(n=5)、批间试验CV为0.76%~1.98%(n=3)。运用此方法随机检测45份草莓样品,检测出3份阳性样品。该检测方法灵敏、特异、重复性好,可应用于水果和蔬菜中甲肝病毒的快速检测。

英文摘要:

A SYBR GreenⅠ real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) method using the primers designed to encompassing the conservative region of vp3/vp1 in the HAV was developed for the detection of HAV in strawberry.The limit of detection of the method was 101 TCID50.The standard curve was Ct =-3.052 lg(TCID50 )+ 34.57,displaying good linearity over a linear range from 101 to 105 TCID50 with 0.9961 correlation coefficient.This method was specific to HAV without any cross-reaction with rotavirus,adenovirus,norovirus or astrovirus.The coefficients of variation (CV) for determining HAV standards with different titers by this method were between 0.85% and 1.71% (n = 5) in intra-assay and between 0.76% and 1.98% (n = 3) in inter-assay.Totally 45 strawberry samples were examined,and 3 of them were found positive.This method is sensitive,specific and reliable,and can be used for the rapid detection of HAV in fruits and vegetables.

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期刊信息
  • 《食品科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:北京市食品研究所
  • 主编:孙勇
  • 地址:北京西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:foodsci@126.com
  • 电话:010-83155446-8006
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-6630
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2206/TS
  • 邮发代号:2-439
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,1986年原商业部重大成果三等奖,1997年国内贸易部优秀科技期刊三等奖,第三届中国出版政府奖提名奖,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:115579