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乌鬃鹅α干扰素基因的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1674-6422
  • 期刊名称:《中国动物传染病学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.42[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013, [2]福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福州350013
  • 相关基金:基金项目:国家公益性行业科研专项(201003012);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-43)
中文摘要:

采用RT-PCR方法从乌鬃鹅肝脏中扩增a干扰素(Interferon,IFN-a)基因片段,将扩增片段克隆到pMD18-T载体上,经PCR和双酶切鉴定为阳性后进行序列测定,并用生物信息学软件Lasergene v7.1DNAStar和在线分析方法对IFN—a基因的核苷酸序列及其氨基酸序列进行了生物信息学分析,同时与GenBank中登录的鸡、鸭和鹅IFN.仅基因核苷酸序列进行同源性比较分析。结果表明,所扩增的IFN—a基因编码完整的开放阅读框,基因长度为576bp,与鸡、鸭与鹅IFN-a基因核苷酸序列同源性在72.0%~99.7%,遗传进化树显示鸡、鸭、鹅IFN-a因在遗传进化上各处一支。乌鬃鹅IFN-a基因的克隆及生物信息学分析为进一步研究鹅干扰素抗病毒的作用机理奠定基础。

英文摘要:

A IFN-a gene was amplified from the liver tissue of Wuzong goose using RT-PCR and was cloned into the vector pMD18-T -the positive clones were confirmed by PCR and restriction enzyme digestion. The nucleotide sequences of the amplified IFN-a and the amino acid sequences deduced from the gene were the analyzed by the bioinformatice software Lasergene v7.1 DNAStar and on-line tools. The similarity and evolution of IFN-a gene were analyzed among Wuzong goose and otherl5 species of poultry (chicken, duck and goose). These results revealed that the cloned-successfully IFN-a gene shared 72.0%-99.7% similarity with that of the 15 species of poultry, and they had it's own independent branch in the phylogenetic tree. The study laid the foundations for the further study of mechanism of goose interferon antivirus.

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期刊信息
  • 《中国动物传染病学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院上海兽医研究所
  • 主编:童光志
  • 地址:上海市闵行区紫月路518号
  • 邮编:200241
  • 邮箱:bianjibu@shrri.ac.cn
  • 电话:021-34293142
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-6422
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2031/S
  • 邮发代号:4-748
  • 获奖情况:
  • 第二届全国畜牧兽医优秀期刊二等奖,首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1517