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蜱螨线粒体基因组研究进展
  • ISSN号:0454-6296
  • 期刊名称:昆虫学报
  • 时间:2012
  • 页码:472-481
  • 分类:Q966[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]兰州大学草地农业科技学院,草地农业生态系统国家重点实验室,兰州730020, [2]西南大学植物保护学院,重庆市昆虫学及害虫控制工程重点实验室,重庆400716
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31171851); 兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(lzujbky-2012-91)致谢感谢兰州大学草地农业科技学院李春杰教授和段廷玉副教授对本文的审阅和提出的宝贵意见和建议.
  • 相关项目:基于微卫星与线粒体标记的柑桔全爪螨种群遗传结构研究
中文摘要:

蜱螨亚纲包括蜱类和螨类,是节肢动物中物种多样性最高的类群之一。本文综述了当前已测序的28种蜱螨线粒体基因组的研究成果。概括起来,蜱螨线粒体基因组具有以下特点:(1)大小变异显著,其中柑橘全爪螨Panonychuscitri线粒体基因组在目前已测节肢动物中最小(13077bp);(2)一般碱基组成偏向A和T,但6种蜱螨具有相反的GC-偏斜(正值);(3)基因组的碱基组成及A+T富集区的位置、长度和拷贝数等变异显著,其中4种叶螨的A+T含量最高,其A+T富集区在目前已测节肢动物中最短(44~57bp);(4)基因高度重排,特别是真螨总目的种类,但重排与高分类阶元无相关性;(5)真螨总目部分螨类的tRNA基因极度缩短,不能形成经典的三叶草二级结构。作者建议要进一步测定更多蜱螨的线粒体基因组,验证蜱螨非典型tRNA基因的生物学功能性,分析蜱螨线粒体基因组的分子进化机制,开展蜱螨线粒体转录组研究等。

英文摘要:

Acari,including ticks and mites,is one of the most diverse group of arthropods.In this paper,we reviewed the research progress in the 28 sequenced complete mitochondrial genomes of acari species.These mitochondrial genomes have several marked features:(1) There is significant variation in the size of mitochondrial genomes among the 28 acari species,and the mitochondrial genome of Panonychus citri(13 077 bp) is the smallest among all sequenced arthropods;(2) The base composition of all acari mitochondrial genomes are biased toward A and T,with six species harboring reverse GC-skew values(positive value);(3) The base composition and the position,length,copy number of the A+T-rich regions vary greatly among the 28 acari species,of which four tetranychid species harbor the highest A+T content within acari and the shortest A+T-rich region(44-57 bp) among arthropods;(4) High gene rearrangements are found in acari mitochondrial genomes,especially in those of Acariformes,but the rearrangements are not correlated to high taxonomic ranks;(5) The tRNA genes in some species of Acariformes are extremely truncated,presenting atypical cloverleaf structures.We suggest that it is necessary to sequence more acari mitochondrial genomes aiming to investigate whether these tRNA genes lacking both D-and T-arms are functional or not,to analyze the molecular mechanisms of evolution in acari mitochondrial genomes,and to carry out the acari mitochondrial transcriptome studies.

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期刊信息
  • 《昆虫学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:黄大卫
  • 地址:北京东中关村中国科学院动物研究所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:kcxb@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807173 010-64807099
  • 国际标准刊号:ISSN:0454-6296
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1832/Q
  • 邮发代号:2-153
  • 获奖情况:
  • 国家期刊方阵“双百期刊”
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16190